ردیابی نشانه های انتخاب مثبت در نژاد های گوسفند ایرانی افشاری و مغانی با استفاده از اطلاعات ژنگانی
عنوان مقاله: ردیابی نشانه های انتخاب مثبت در نژاد های گوسفند ایرانی افشاری و مغانی با استفاده از اطلاعات ژنگانی
شناسه ملی مقاله: JR_IJAS-48-4_011
منتشر شده در شماره 4 دوره 48 فصل در سال 1396
شناسه ملی مقاله: JR_IJAS-48-4_011
منتشر شده در شماره 4 دوره 48 فصل در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:
زهره یوسفی - دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
محمدتقی بیگی نصیری - استاد، گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
محمد حسین مرادی - استادیار، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه اراک
رستم عبداللهی آرپناهی - استادیار، پردیس ابوریحان دانشگاه تهران
خلاصه مقاله:
زهره یوسفی - دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
محمدتقی بیگی نصیری - استاد، گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
محمد حسین مرادی - استادیار، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه اراک
رستم عبداللهی آرپناهی - استادیار، پردیس ابوریحان دانشگاه تهران
شناسایی مناطق ژنگانی (ژنومی) تحت انتخاب مثبت از بحث های مهم در حوزه ژنتیک جمعیت است. هدف این تحقیق، شناسایی مناطقی از ژنگان گوسفندان افشاری و مغانی است که تحت تاثیر انتخاب طبیعی یا مصنوعی قرار گرفتهاند. برای این منظور 75 راس گوسفند از دو نژاد افشاری (41 راس) و مغانی (34 راس)، با استفاده از آرایههای ژنگانیIllumina Ovine SNP50K BeadChip تعیین نژادگان (ژنوتیپ) شدند. برای ردیابی نشانههای انتخاب مثبت، از آزمون نااریب FST(تتا) در بسته نرمافزاری Lokern در محیط R استفاده شد. نتایج این تحقیق منجر به شناسایی 16منطقه ژنگانی روی کروموزومهای 2، 3، 4، 8، 9، 13، 15، 22 و 26 شد که هدف انتخابهای مثبت در این نژادها قرارگرفته بودند. بیشتر این ژنها در مسیرهای انتقال سیگنال در طیف گستردهای از فرآیندهای سلولی و بیوشیمیایی نقش داشتند. به ویژه، نشانههای انتخاب پوشاننده چندین ژن که به طور مستقیم یا غیرمستقیم بر فرآیندهای تجمع رنگدانه در پوست (EDN3، BNC2)، ریخت شناختی (مورفولوژی) اسکلت یا ساختار و اندازه بدن (BMP2، EXT2،ALX4)، تنظیم سوخت وساز (PPP1R3D) و پاسخ ایمنی (IL2RB) مرتبط بودند، شناسایی شدند. مکانهای ژنی شناساییشده نشان میدهد که انتخابهای انجام شده در فرآیند و روند تکامل و سازگار شدن با محیط و شرایط جغرافیایی متفاوت، منجر به تفرق جمعیتی نژادهای افشاری و مغانی شده است. بنابراین، نتایج به دست آمده از این تحقیق میتواند نقش مهمی در ردیابی مناطق ژنگانی مرتبط با صفات پدیدگانی (فنوتیپی) متمایزکننده این دو نژاد بومی داشته باشد.
کلمات کلیدی: ژن های کاندید, شاخص تمایز جمعیتی, گوسفند افشاری, گوسفند مغانی, نشانه انتخاب
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1015761/