CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

ردیابی نشانه های انتخاب مثبت در نژاد های گوسفند ایرانی افشاری و مغانی با استفاده از اطلاعات ژنگانی

عنوان مقاله: ردیابی نشانه های انتخاب مثبت در نژاد های گوسفند ایرانی افشاری و مغانی با استفاده از اطلاعات ژنگانی
شناسه ملی مقاله: JR_IJAS-48-4_011
منتشر شده در شماره 4 دوره 48 فصل در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:

زهره یوسفی - دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
محمدتقی بیگی نصیری - استاد، گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
محمد حسین مرادی - استادیار، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه اراک
رستم عبداللهی آرپناهی - استادیار، پردیس ابوریحان دانشگاه تهران

خلاصه مقاله:
شناسایی مناطق ژنگانی (ژنومی) تحت انتخاب مثبت از بحث های مهم در حوزه ژنتیک جمعیت است. هدف این تحقیق، شناسایی مناطقی از ژنگان گوسفندان افشاری و مغانی است که تحت ­تاثیر انتخاب طبیعی یا مصنوعی قرار گرفته­اند. برای این منظور 75 راس گوسفند از دو نژاد افشاری (41 راس) و مغانی (34 راس)، با استفاده از آرایه­های ژنگانیIllumina Ovine SNP50K BeadChip تعیین نژادگان (ژنوتیپ) شدند. برای ردیابی نشانه­های انتخاب مثبت، از آزمون نااریب FST(تتا) در بسته نرم­افزاری Lokern در محیط R استفاده شد. نتایج این تحقیق منجر به شناسایی 16منطقه ژنگانی روی کروموزوم­های 2، 3، 4، 8، 9، 13، 15، 22 و 26 شد که هدف انتخاب­های مثبت در این نژادها قرارگرفته بودند. بیشتر این ژن­ها در مسیر­های انتقال سیگنال­ در طیف گسترده­ای از فرآیند­های سلولی و بیوشیمیایی نقش داشتند. به ویژه، نشانه­های انتخاب پوشاننده چندین ژن که به طور مستقیم یا غیر­مستقیم بر فرآیند­های تجمع رنگدانه­ در پوست (EDN3، BNC2)، ریخت شناختی (مورفولوژی) اسکلت یا ساختار و اندازه بدن (BMP2، EXT2،ALX4)، تنظیم سوخت وساز (PPP1R3D) و پاسخ ایمنی (IL2RB) مرتبط بودند، شناسایی شدند. مکان­های ژنی شناسایی­شده نشان می­دهد که انتخاب­های انجام شده در فرآیند و روند تکامل و سازگار شدن با محیط و شرایط جغرافیایی متفاوت، منجر به تفرق جمعیتی نژادهای افشاری و مغانی شده است. بنابراین، نتایج به دست آمده از این تحقیق می­تواند نقش مهمی در ردیابی مناطق ژنگانی مرتبط با صفات پدیدگانی (فنوتیپی) متمایزکننده این دو نژاد بومی داشته باشد.

کلمات کلیدی:
ژن های کاندید, شاخص تمایز جمعیتی, گوسفند افشاری, گوسفند مغانی, نشانه انتخاب

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1015761/