مختار غفاری
مصطفی صادقی
اردشیر نجاتی جوارمی
محمد مرادی شهر بابک
رضا فرجی

هدف از این تحقیق، مطالعه چند­شکلی در ناحیه پروموتور ژن پروتئین شوک حرارتی و ارتباط آن با صفت نرخ باروری در گاوهای هلشتاین و سرابی می­باشد. به این منظور از 124 راس گاو شیرده شامل هلشتاین و سرابی استخراج DNA انجام پذیرفت و برای شناسایی چندشکلی از روش تفاوت فرم فضایی رشته های منفرد (SSCP) استفاده گردید. نتایج حاصل از توالی­یابی و هم­ردیف­سازی با توالی ثبت شده در NCBI نشان داد که در این ناحیه هفت SNP وجود دارد که شامل: یک حذف در نوکلئوتید شماره 895، چهار نوع جایگزینی هم­جنس و همچنین دو نوع جایگزینی غیرهم­جنس مشاهده گردید. ترکیب این SNP­ها شامل چهار نوع هاپلوتایپ شماره یک (CAAAGCC)، شماره دو (DGGCTTC)، شماره سه (CDGGCTTT) و شماره چهار (CGGAGTT) بود. در نژاد سرابی هاپلوتیپ شماره سه و در نژاد هلشتاین هاپلوتیپ شماره یک مشاهده نشد. اثرات ثابت موثر بر صفت نرخ آبستنی، با استفاده از رویه GLM نرم افزار SAS آنالیز گردید. نتایج بیانگر ارتباط معنی­دار هاپلوتایپ­های مشاهده شده در این ناحیه با نرخ باروری است (p

استرس حرارتی, هاپلوتایپ, SNP و PCR-SSCP