طراحی پلی توپ واکسن علیه ویبریو کلرا: رویکردی وارونه برای طراحی واکسن
عنوان مقاله: طراحی پلی توپ واکسن علیه ویبریو کلرا: رویکردی وارونه برای طراحی واکسن
شناسه ملی مقاله: JR_GEB-9-2_003
منتشر شده در در سال 1399
شناسه ملی مقاله: JR_GEB-9-2_003
منتشر شده در در سال 1399
مشخصات نویسندگان مقاله:
مینا عقبی طلب - Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Tehran, Iran
محمدجواد دهقان عصمت ابادی - Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Tehran, Iran
علیرضا سعیدی نیا - Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Tehran, Iran
محمدعلی یعقوبی مقدم - Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Tehran, Iran
خلاصه مقاله:
مینا عقبی طلب - Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Tehran, Iran
محمدجواد دهقان عصمت ابادی - Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Tehran, Iran
علیرضا سعیدی نیا - Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Tehran, Iran
محمدعلی یعقوبی مقدم - Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Tehran, Iran
طراحی واکسن درگذشته تا به امروز براساس روشهای کلاسیک صورت میگیرد که زمانبر، هزینهبر و دارای ملاحظاتی هستند، اما با کشف ژنوم و تعیین توالی ژن، روشهای مدرنی برای طراحی واکسن ابداع شده که از جمله آن میتوان به روش طراحی واکسن به روش معکوس اشاره کرد. در این پژوهش از سرور NCBI (ORF Finder) به منظور یافتن توالیهای Coding و برای مکانیابی پروتئین از سرور PSORTb استفاده شده و بررسی آلرژنیک بودن پروتئین از سرور Algpred و به منظور پیشبینی اپی توپ خطی و فضایی از سرورهای LBtope – ABCpred - IEDB CBTOPE - Disco Tope ۲.۰ – IEDB (Ellipro) اپی توپ نهایی انتخاب شده و سپس تجزیه و تحلیل سازه پلی توپی را توسط سرور ExPasy (ProtParam) بررسی کردیم و در نهایت با سرور JCat توالی نوکلئوتیدی بهینه شده را بدست آوردیم. با استفاده از این روش ۶۰۷۴ چارچوب خوانش و همچنین ۴۳ پروتیین سطحی و ترشحی شناسایی گردیده که در نهایت، ۱۰ اپی توپ مناسب به عنوان کاندیدای واکسن قادر به ایجاد ایمنی در برابر طیف وسیعی از سویهها می باشند، امید است که راه پیشرفت تولید این واکسن را بسیار آسان کنند.
کلمات کلیدی: bioinformatics, polytope vaccine, protein, agent of cholera, reverse vaccinology, بیوانفورماتیک, سازه پلی توپی, پروتئین, عامل وبا, واکسن سازی به روش معکوس
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1274283/