تغییرات صحت ارزش های اصلاحی ژنومی تحت تاثیر روش های آماری برآورد اثر نشانگری، خصوصیات جمعیت و معماری ژنتیکی صفت
عنوان مقاله: تغییرات صحت ارزش های اصلاحی ژنومی تحت تاثیر روش های آماری برآورد اثر نشانگری، خصوصیات جمعیت و معماری ژنتیکی صفت
شناسه ملی مقاله: JR_RAP-11-30_012
منتشر شده در در سال 1399
شناسه ملی مقاله: JR_RAP-11-30_012
منتشر شده در در سال 1399
مشخصات نویسندگان مقاله:
عباس عاطفی - Department of Animal Science, Guilan University
عبدالاحد شادپرور - Department of Animal Science, Guilan University
نوید قوی حسین زاده - Department of Animal Science, Guilan University
خلاصه مقاله:
عباس عاطفی - Department of Animal Science, Guilan University
عبدالاحد شادپرور - Department of Animal Science, Guilan University
نوید قوی حسین زاده - Department of Animal Science, Guilan University
هدف تحقیق حاضر بررسی اثر روش برآورد اثرات نشانگرها، توزیع اثرات QTLها، تعداد QTL، اندازه موثر جمعیت و وراثت پذیری صفت بر صحت ارزیابی های ژنومی بود. جمعیت پایه با دو اندازه موثر ۱۰۰ و ۵۰۰ فرد در نظر گرفته شده و به وسیله نرم افزار QMSim شبیه سازی شد. برای انجام این تحقیق، ژنومی متشکل از یک کروموزوم به طول ۱۰۰ سانتیمورگان با تعداد ۵۰۰ نشانگر SNP در طول ژنوم و با تعداد متفاوت QTL (۵۰ و ۲۰۰) که آنها نیز به طور تصادفی روی کروموزوم پراکنده شدهاند شبیه سازی شد. مقادیر وراثتپذیری بررسی شده در تحقیق حاضر نماینده صفات با وراثتپذیری پایین (۰/۱)، متوسط (۰/۳) و بالا (۰/۵) بودند. ارزشهای اصلاحی ژنومی بهوسیله روشهای رگرسیون ریج بیزی (BRR)، بیز A( BayesA)، بیز B( BayesB)، بیز C(BayesC)، بیز لزو ) BayesL)، روش نیمه پارامتری بر پایه کرنل (RKHS ) و شبکه های عصبی (NN) پیشبینی شدند. بر اساس نتایج به دست آمده، عوامل وراثتپذیری، اندازه موثر جمعیت، روش برآورد اثرات نشانگری، توزیع QTL و تعداد QTL بر صحت ارزیابی ژنومی تاثیر محسوسی داشتند. بین روشهای برآورد اثرات نشانگری، روشهای بیز A و B بیشترین و روش شبکه های عصبی کمترین صحت را داشتند. در تحقیق حاضر با افزایش وراثتپذیری و تعداد QTL، صحت پیش بینی های ژنومی افزایش و برعکس با کاهش اندازه موثر جمعیت، کاهش یافت. بیشترین صحت زمانی به دست آمد که QTLها دارای توزیع نرمال بودند.
کلمات کلیدی: Genomic Evaluation, Genetic architecture, Non-parameteric method, Parameteric method e, ارزیابی ژنومی, روش پارامتری, روش ناپارامتری, معماری ژنتیکی صفت
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1274506/