رودخانه کر نقشی کلیدی در عرضه آب برای مصارف مختلف کشاورزی، صنعتی، و شهری در استان فارس ایفا می کند. در چند دهه اخیر توسعه فعالیت های کشاورزی، و صنعتی در اطراف این رودخانه موجب افزایش بار آلودگی آن شده است. در این بررسی، برای ارزیابی زیست محیطی آلودگی رودخانه کر به عناصر آرسنیک، کادمیم، کرم، مس، جیوه، مولیبدن، نیکل، سرب، و روی،  تعیین منشاء عناصر، غلظت حل شده عناصر در آب سطحی رودخانه و ورودی های مختلف آن، غلظت کل عناصر در رسوبات سطحی و مغزه های آن، گونه سازی عناصر در رسوبات سطحی، و غلظت اسیدشویی شده عناصر در مغزه های رسوب رودخانه مورد مطالعه قرار گرفته است. نتایج نشان می دهد که بخش هایی از رودخانه کر به شدت تحت تاثیر پساب های خروجی واحدهای مختلف صنعتی، زهاب کشاورزی و رواناب شهری- روستایی به درون رودخانه کر می باشد. بنابراین برای جلوگیری از فروکاهی بیشتر کیفیت رودخانه کر پایش پیوسته بر ورودی هیا مختلف رودخانه کر ضرورت دارد.