CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی در ارقام و لاین های گندم ایرانی با استفاده از نشانگرهای SSR

عنوان مقاله: بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی در ارقام و لاین های گندم ایرانی با استفاده از نشانگرهای SSR
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-10-28_007
منتشر شده در در سال 1397
مشخصات نویسندگان مقاله:

رخساره رحمانی اصل - Urmia University
ایرج برنوسی - Urmia University
بابک عبدالهی مندولکانی - Urmia University

خلاصه مقاله:
بهبود ژنتیکی گیاهان زراعی، از جمله گندم متکی بر وجود تنوع ژنتیکی است. در این تحقیق ساختار و تنوع ژنتیکی ۹۹ لاین و ۴۹ رقم گندم با استفاده از ۲۰ جفت آغازگرSSR  بررسی شد. از آغازگرهای مورد استفاده، ۱۹ آغازگر در بین ارقام و لاین ­ها مورد مطالعه چند­شکل بودند و در مجموع ۶۷ آلل چند شکل تکثیر شد. تعداد آلل در هر مکان از ۱ (Xgwm۴۴) تا ۷ (Xgwm۴۷) متغیر و میانگین آن ۵/۳ بود. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار (He) از ۷۱/۰ (Xgwm۱۴۹) تا ۲۷/۰ (Xgwm۴۶۹) متغیر بود. میانگین محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC) و بیشترین شاخص اطلاعاتی شانون (I) به ترتیب ۵۲/۰ و ۸۸/۰ بود. مقادیر تعداد آلل، شاخص اطلاعاتی شانون و میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار در لاین­ های مورد مطالعه کمی بیشتر از ارقام بود. متوسط ضرایب تمایز ژنی بین لاین ­ها و ارقام (Fst) و مقدار جریان ژنی (Nm) برای تمامی آغازگرها به ترتیب برابر ۰۶۷/۰ و ۹۶/۶ بود. تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) سطح بالایی از تنوع ژنتیکی را درون لاین­ ها + ارقام (۹۲%) در مقایسه با بین لاین­ ها و ارقام (۸%) نشان داد. تجزیه خوشه ­ای بر اساس ضرایب تشابه تطابق ساده به روش UPGMA انجام شد. دامنه ضرایب تشابه از ۴۰/۰ تا ۱ متغیر و میانگین آن ۷/۰ بود. بر اساس تجزیه خوشه­ ای ۱۴۸ لاین و رقم گندم در ۵ گروه اصلی قرار گرفت. برخی لاین ها که در گروه­ های مشابه قرار گرفتند از نظر منشاء جغرافیایی نزدیک به هم بودند. شباهت ژنتیکی بالای بین ارقام می ­تواند نشان­ دهنده کاهش پایه ژنتیکی ژرم ­پلاسم گندم نان­ در ایران باشد. به هر حال مطابق با فاصله ژنتیکی بین گروه ­های مختلف، لاین­ ها می ­توانند به عنوان والدین بالقوه در برنامه ­های اصلاحی گندم مورد استفاده قرار بگیرند.  

کلمات کلیدی:
Bread wheat, SSR markers, Expected heterozygosity, Shannon’s information index, Polymorphism Information Content, گندم نان, نشانگرهایSSR, هتروزیگوسیتی موردانتظار, شاخص اطلاعاتی شانون, محتوای اطلاعات چند شکلی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1284663/