CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

ارزیابی تنوع ژنتیکی بین و درون تیپ های مختلف توتون با استفاده از نشانگرهای IRAP و REMAP

عنوان مقاله: ارزیابی تنوع ژنتیکی بین و درون تیپ های مختلف توتون با استفاده از نشانگرهای IRAP و REMAP
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-7-16_001
منتشر شده در در سال 1394
مشخصات نویسندگان مقاله:

سیده فاطمه حسنی تسیه - دانشگاه گیلان،
حبیب الله سمیع زاده لاهیجی - دانشگاه گیلان،
مرداویج شعاعی دیلمی - مرکز تحقیقات توتون گیلان

خلاصه مقاله:
در این مطالعه به­منظور بررسی تنوع ژنتیکی ۴۵ ژنوتیپ از ژرم­پلاسم تیپ­های مختلف توتون شامل گرمخانه­ای، بارلی و شرقی، از ۲۰ ترکیب آغازگری IRAP و REMAP استفاده شد که از بین این آغازگرها، ۵ آغازگر IRAP و ۹ آغازگر REMAP قادر به تولید الگوی نواری، با وضوح و چندشکلی بالا بودند و در مجموع ۱۸۸ مکان را تکثیر کردند که از این تعداد ۱۵۳ مکان، چندشکل بودند. آغازگر RTR-۱۰ با ۲۲ نوار و RTR-۱ با ۱۶ نوار، بیشترین و آغازگر UBC۸۱۷+RTR۱ با ۴ نوار، کمترین تعداد مکان­های چند شکل را تکثیر کردند. میزان اطلاعات چندشکل نشانگرها بین ۱۶/۰ تا ۳۳/۰ و شاخص نشانگر از ۳۴/۰ تا ۲۵/۶ در کل ژنوتیپ­های مورد مطالعه متغیر بود. تجزیه خوشه­ای به روش UPGMA، ۴۵ ژنوتیپ مورد مطالعه را در پنج گروه قرار داد، که گروه اول شامل تیپ بارلی، گروه دوم شامل تیپ گرمخانه­ای و گروه­های ۳، ۴ و ۵ شامل ژنوتیپ­های شرقی شدند. صحت گروه­بندی حاصل از تجزیه خوشه­ای توسط تابع تشخیص کانونی به روش خطی فیشر ۳/۷۳ درصد تایید شد.

کلمات کلیدی:
Retrotransposon, Simple Matching Coefficient, Polymorphism InformationContect, رتروترانسپوزون, ضریب تشابه انطباق ساده, میزان اطلاعات چندشکل

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1284919/