ارزیابی تنوع ژنتیکی بین و درون تیپ های مختلف توتون با استفاده از نشانگرهای IRAP و REMAP
عنوان مقاله: ارزیابی تنوع ژنتیکی بین و درون تیپ های مختلف توتون با استفاده از نشانگرهای IRAP و REMAP
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-7-16_001
منتشر شده در در سال 1394
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-7-16_001
منتشر شده در در سال 1394
مشخصات نویسندگان مقاله:
سیده فاطمه حسنی تسیه - دانشگاه گیلان،
حبیب الله سمیع زاده لاهیجی - دانشگاه گیلان،
مرداویج شعاعی دیلمی - مرکز تحقیقات توتون گیلان
خلاصه مقاله:
سیده فاطمه حسنی تسیه - دانشگاه گیلان،
حبیب الله سمیع زاده لاهیجی - دانشگاه گیلان،
مرداویج شعاعی دیلمی - مرکز تحقیقات توتون گیلان
در این مطالعه بهمنظور بررسی تنوع ژنتیکی ۴۵ ژنوتیپ از ژرمپلاسم تیپهای مختلف توتون شامل گرمخانهای، بارلی و شرقی، از ۲۰ ترکیب آغازگری IRAP و REMAP استفاده شد که از بین این آغازگرها، ۵ آغازگر IRAP و ۹ آغازگر REMAP قادر به تولید الگوی نواری، با وضوح و چندشکلی بالا بودند و در مجموع ۱۸۸ مکان را تکثیر کردند که از این تعداد ۱۵۳ مکان، چندشکل بودند. آغازگر RTR-۱۰ با ۲۲ نوار و RTR-۱ با ۱۶ نوار، بیشترین و آغازگر UBC۸۱۷+RTR۱ با ۴ نوار، کمترین تعداد مکانهای چند شکل را تکثیر کردند. میزان اطلاعات چندشکل نشانگرها بین ۱۶/۰ تا ۳۳/۰ و شاخص نشانگر از ۳۴/۰ تا ۲۵/۶ در کل ژنوتیپهای مورد مطالعه متغیر بود. تجزیه خوشهای به روش UPGMA، ۴۵ ژنوتیپ مورد مطالعه را در پنج گروه قرار داد، که گروه اول شامل تیپ بارلی، گروه دوم شامل تیپ گرمخانهای و گروههای ۳، ۴ و ۵ شامل ژنوتیپهای شرقی شدند. صحت گروهبندی حاصل از تجزیه خوشهای توسط تابع تشخیص کانونی به روش خطی فیشر ۳/۷۳ درصد تایید شد.
کلمات کلیدی: Retrotransposon, Simple Matching Coefficient, Polymorphism InformationContect, رتروترانسپوزون, ضریب تشابه انطباق ساده, میزان اطلاعات چندشکل
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1284919/