بررسی و تحلیل فیلوژنتیکی ناحیه COXI در برخی از نژادهای بز ایرانی
عنوان مقاله: بررسی و تحلیل فیلوژنتیکی ناحیه COXI در برخی از نژادهای بز ایرانی
شناسه ملی مقاله: JR_AEJO-11-1_010
منتشر شده در در سال 1398
شناسه ملی مقاله: JR_AEJO-11-1_010
منتشر شده در در سال 1398
مشخصات نویسندگان مقاله:
رضا سید شریفی - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران
نجات بادبرین - مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان کرمانشاه، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرمانشاه، ایران
خلاصه مقاله:
رضا سید شریفی - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران
نجات بادبرین - مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان کرمانشاه، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرمانشاه، ایران
DNA میتوکندریایی یکی از گسترده ترین نشانگرهای مولکولی برای مطالعات فیلوژنتیک در حیوانات به علت ساختار ژنوم ساده آن است.این مطالعه ویژگی های ژنتیکی بزهای بومی را با استفاده از تجزیه و تحلیل توالی ( DNA Cytocrome oxidase I (COXI برای شناسایی و تمایز بین سه نژاد (نجدی، عدنی و مرخز) ایران بررسی می کند. استخراج DNA با استفاده از روش بهینه شده نمکی انجام شد و ژن سیتوکروم اکسیداز I به روش PCR با یک جفت پرایمر، تکثیر گردید. درخت فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزار ۶ Mega به دست آمد. توالی COXI از ۶۰ بز دارای تنوع هاپلوتیپی ۰/۴۷ و تنوع نوکلئوتیدی ۰/۰۰۰۵ بود. تجزیه و تحلیل ها به کمک رویه Composition برنامه BioEdit نشان داد این توالی برای ناحیه COXI شامل ۲۸/۹۷ درصد نوکلئوتید A و ۲۵/۵۲ درصد نوکلئوتید C و ۱۵/۸۶ درصد نوکلئوتید G و ۶۶/۲۹ درصد نوکلئوتید T می باشد که نسبت C+G، چهل و دو درصد و A+T، پنجاه و هشت درصد است. ارتباط تکاملی به وسیله درخت فیلوژنتیک نمایش داده شد.درخت فیلوژنی نشان داد که بزهای ایرانی در یک شاخه جداگانه خوشه بندی شده است. این نتیجه به طور گسترده از توزیع جغرافیایی این نژاد ها در ایران پیروی می کند و می تواند در طراحی برنامه های حفاظت و مدیریت نژادهای بز ایرانی مورد استفاده قرار گیرد.
کلمات کلیدی: COXI, تنوع ژنتیکی, آنالیز فیلو ژنتیکی, بز ایران
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1305538/