Feature Selection Using a Genetic Algorithms and Fuzzy logic in Anti-Human Immunodeficiency Virus Prediction for Drug Discovery

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 146

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JITM-14-5_002

تاریخ نمایه سازی: 25 بهمن 1400

چکیده مقاله:

This paper presents an approach that uses both genetic algorithm (GA) and fuzzy inference system (FIS), for feature selection for descriptor in a quantitative structure activity relationships (QSAR) classification and prediction problem. Unlike the traditional techniques that employed GA, the FIS is used to evaluate an individual population in the GA process. So, the fitness function is introduced and defined by the error rate of the GA and FIS combination. The proposed approach has been implemented and tested using a data set with experimental value anti-human immunodeficiency virus (HIV) molecules. The statistical parameters q۲ (leave many out) is equal ۰.۵۹ and r (coefficient of correlation) is equal ۰.۹۸. These results reveal the capacity for achieving subset of descriptors, with high predictive capacity as well as the effectiveness and robustness of the proposed approach.

نویسندگان

Labjar

Researcher, Laboratory Processes and Environment, Faculty of Sciences and Technology, University Hassan II Casablanca, Mohammedia, Morocco.

Al-Sarem

Associate Professor, Information System Departement, Taibah University, Al-Madinah Al-Monawarah, Saudi Arabia.

Kissi

Full Professor, LIM Laboratory, Computer Science Department, Faculty of Sciences and Technology, University Hassan II Casablanca, Mohammedia, Morocco.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Danishuddin, M., & Khan, A. U. (۲۰۱۶). Descriptors and their ...
  • Fenner, K., & Tratnyekc, P. G. (۲۰۱۷). QSARs and computational ...
  • Swathik, C. P., Jaspreet, K. D., Vidhi, M., Navaneethan, R., ...
  • Hdoufane, I., Stoycheva, J., Tadjer, A., Villemin, D., Najdoska-Bogdanov, M., ...
  • Todeschini, R., & Consonni, V. (۲۰۰۹). Molecular Descriptors for Chemoinformatics, ...
  • Wutzl, B., Leibnitz, K., Rattay, F., Kronbichler, M., Murata, M., ...
  • Nagasubramanian, K., Jones, S., Sarkar, S., Singh, A. K., Singh, ...
  • Labjar, H., Kissi, M., Mouhibi, R., Khadir, O., Chaair, H., ...
  • Salari, N., Shohaimi, S., Najafi, F., Nallappan, M., & Karishnarajah, ...
  • Srivastava, A. K., Singh, D., Pandey, A. S., & Maini, ...
  • Guyon, I., Weston, J., Barnhill, S., & Vapnik, V. (۲۰۰۲). ...
  • Lal, T.N., Chapelle, O., Weston, J., & Elisseeff, A. (۲۰۰۶). ...
  • Swathik, C. P., Jaspreet, K. D., Vidhi, M., Navaneethan, R., ...
  • Racz, A., Bajusz, D., & Héberger, K. (۲۰۱۹). Intercorrelation Limits ...
  • Pourbasheer, E., Aalizadeh, R., Ganjali, M. R., Norouzi, P., Shadmanesh, ...
  • Holland, J. H. (۱۹۹۲). Adaptation in Natural and Artificial Systems. ...
  • Takagi, T., & Sugeno, M. (۱۹۸۵). Fuzzy identification of systems ...
  • Jang, J.S.R. (۱۹۹۳). ANFIS: Adaptive-Network-Based Fuzzy Inference systems. IEEE Trans. ...
  • Tanaka, H., Takashima, H., Ubasawa, M., Sekiya, K., Nitta, I., ...
  • MMP, molecular modelling pro-Demo (TM) Revision ۳۰۱ demo. ChemSW Software ...
  • Anacleto de Souza, S., Leonardo Ferreira, L. G., Aldo de ...
  • Wen, L., Li, Q., Li, W., Cai, Q., & Cai., ...
  • Marunnan, S. M., Pulikkal, B. P., Jabamalairaj, A., Bandaru, S., ...
  • Chakravarti, S. K., & Alla S. R. M. (۲۰۱۹). Descriptor ...
  • نمایش کامل مراجع