CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی تراکم چندشکلی های تک نوکلئوتیدی (اسنیپ) موثر بر دنبه گوسفند

عنوان مقاله: بررسی تراکم چندشکلی های تک نوکلئوتیدی (اسنیپ) موثر بر دنبه گوسفند
شناسه ملی مقاله: ECONF11_222
منتشر شده در یازدهمین همایش سراسری محیط زیست، انرژی و منابع طبیعی پایدار در سال 1400
مشخصات نویسندگان مقاله:

منا چعبی - دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشگاه منابع کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان
جمال فیاضی - استاد گروه عوم دامی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان
هدایت اله روشنفکر - استاد گروه عوم دامی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان
محمود نظری - استادیار گروه عوم دامی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان
محمدحسین مرادی - دانشیار گروه عوم دامی دانشگاه اراک

خلاصه مقاله:
نژادهای مختلفی از گوسفندان با فنوتیپ مختلف از نظر دنبه، در اثر انتخاب طبیعی و مصنوعی پس از اهلی شدن گوسفند ایجاد شدهاند. هدف این پژوهش، یافتن بخشهای مختلف ژنوم گوسفند که بر تشکیل دنبه موثرند میباشد. از تراشه های ۵۰K اسنیپ شرکت ایلومینا برای تعیین ژنوتیپ گوسفندان موجود در فاز اول پروژه هپ مپ استفاده شد. فنوتیپ گوسفندان بر اساس بود و نبود دنبه به صورت ۰ و ۱ کدگذاری شد. رگرسیون خطی برای پی بردن به اسنیپ های موثر بر فنوتیپ به کار گرفته شد و نتایج به صورت -Log Pvalue در قالب نمودار منهتن ارائه شد. با تصحیح بنفرونی سطح ۰,۰۰۰۰۰۱ بعنوان سطح معنی داری تعیین شد. تصحیح ساختاری انجام نشد تا تمامی اسنیپ های موثر ولی با اندازه کم بر اساس مدل بینهایت لوکوس با اثر کم دیده شوند. یافته های پژوهش حاکی از آن است که کروموزوم های یک، دو و سه بیشترین اسنیپ موثر بر تشکیل دنبه را داشته اند. اسنیپ های s۰۳۶۸۶,۱ در کروموزوم ۲۵ و اسنیپ OARX_۶۳۵۷۱۷۸۹.۱ در کروموزوم ۲۷ تاثیر بیشتری در ایجاد دنبه داشته اند. نتایج این پژوهش می تواند به اصلاح گران برای کنترل اندازه دنبه و به متخصصین پزشکی برای درک مکانیسم رسوب چربی در بدن انسان کمک کند.

کلمات کلیدی:
دنبه، اسنیپ، ایلومینا، پروژه هپ مپ

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1410936/