CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

رویکردی جهت افزایش دقت پیش بینی و تخمین ساختار RNA ها با استفاده از شبکه عصبی عمیق

عنوان مقاله: رویکردی جهت افزایش دقت پیش بینی و تخمین ساختار RNA ها با استفاده از شبکه عصبی عمیق
شناسه ملی مقاله: DCBDP07_034
منتشر شده در هفتمین کنفرانس ملی و اولین کنفرانس بین المللی محاسبات توزیعی و پردازش داده های بزرگ در سال 1401
مشخصات نویسندگان مقاله:

سمیه اسکندری - گروه مهندسی کامپیوتر، واحد نجف آباد، دانشگاه آزاد اسلامی، اصفهان، ایران
فرامرز صافی اصفهانی - دانشیار، گروه مهندسی کامپیوتر، واحد نجف آباد، دانشگاه آزاد اسلامی، اصفهان، ایران

خلاصه مقاله:
پیش بینی ساختار RNA از نظر زیست شناسی مولکولی، مبحثی پرکاربرد است. اطلاعات موجود در DNA، توسط RNA به پروتئین تبدیل می شود و پروتئین ها نیز در بدن انسان ها مسئول اجرای بسیاری از توابع سلولی هستند. به دلیل عدم استفاده از شبکه های عصبی کارا، پژوهش هایی که تا به امروز در زمینه پیش بینی ساختار RNA انجام شده است، از نظر دقت پیش بینی، میزان خطا و همچنین سرعت اجرا نتوانسته انتظارات را برآورده کند. با توجه به تاثیر افزایش دقت پیش بینی RNA و ارتباط آن با سلامت انسان، لازم است تا با بهبود دقت و درستی تشخیص دنباله های RNA به تشخیص، پیشگیری و درمان بیماری هایی نظیر سرطان کمک نمود. از این رو در این مقاله، روشی بر پایه شبکه ی عصبی عمیق ارائه شده که بتوانیم به نتایج بهتر و با دقت بالاتری برسیم. در این تحقیق با ارائه یک روش یادگیری عمیق ترکیبی CNN+BiLSTM+CRF، بر روی دنباله های RNA و با استفاده از الگوریتم بهینه سازی ADAM، توانستیم دقت پیش بینی دنباله های RNA را نسبت به کارهای مشابه گذشته بهبود دهیم نتایج حاکی از آن است که میزان دقت پیش بینی توالی RNA روش پیشنهادی، با تعداد لایه بیشتر بر روی مجموعه داده های chip seq, ELK ۱ به ۹۹.۷% رسیده که با کمترین میزان خطا ۰.۰۰۲۵ همراه است

کلمات کلیدی:
پیش بینی ساختار RNA، الگوریتم بهینه سازی، ADAM، یادگیری عمیق ترکیبی.

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1453916/