CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

مقایسه کارایی دو نشانگر کلروپلاستی (psbA-trnH و trnL-F) در تعیین روابط تبارزایی بین گونه های پلاخور (Lonicera spp.) در ایران

عنوان مقاله: مقایسه کارایی دو نشانگر کلروپلاستی (psbA-trnH و trnL-F) در تعیین روابط تبارزایی بین گونه های پلاخور (Lonicera spp.) در ایران
شناسه ملی مقاله: JR_IRSHS-23-1_001
منتشر شده در در سال 1400
مشخصات نویسندگان مقاله:

نجمه فتاحی دهکردی - Shahrekord University
مسعود قاسمی قهساره - Shahrekord University
بهروز شیران - Shahrekord University
مجید صیامپور - Shahrekord University

خلاصه مقاله:
جنس Lonicera از تیره Caprifoliaceae، در زبان فارسی به نام های پلاخور، شونگ و یا پیچ امین الدوله (Honeysuckle) خوانده می شود. شناخت روابط بین گونه ای بر اساس روش های سنتی مانند ویژگی های ریخت شناسانه و ترکیب های شیمیایی گاهی نتایج متناقضی داشته اند. در مطالعه حاضر، به منظور بررسی کارایی رمزینه های DNA در تعیین روابط تبارزایی بین ۱۲ گونه از جنس Lonicera زیر کشت در مناطق مختلف ایران از رمزینه های DNA کلروپلاستی (psbA-trnH و trnL-F) استفاده شد. محتوای DNA ژنومی با استفاده از کیت های موجود استخراج و به منظور تکثیر دو ناحیه مورد نظر واکنش زنجیره ای پلی مراز (PCR) انجام شد و در نهایت نمونه های خالص سازی شده توالی یابی گردیدند. نتایج نشان دادند که طول منطقه psbA-trnH و trnL-F به ترتیب در حدود ۴۳۵-۴۲۰ و ۹۵۰-۹۴۰ نوکلئوتید است. واکاوی پارسیمونی ناحیه psbA-trnH و trnL-F به ترتیب ۳۸۲ و ۸۸۶ جایگاه حفاظت شده، ۵۵ و ۷۱ جایگاه متغیر و ۱۵ و ۱۶ جایگاه پارسیمون را نشان دادند. در درخت تبارزایی ایجاد شده با ناحیه psbA-trnH، بیشترگونه ها به جز L. korolkovii و در ناحیه trnL-F، دو گونه L. korolkovii و L. maackii به خوبی از یکدیگر متمایز شده و در شاخه های متفاوت قرار گرفتند. تنوع و فاصله ژنتیکی (۰۰/۰ تا ۲۰۹/۰) بین گونه ها در ناحیه psbA-trnH بیشتر از فاصله ژنتیکی (۰۰/۰ تا ۰۲۷/۰) ناحیه trnL-F بود. بنابراین، ناحیه psbA-trnH با توجه به تنوع و تکثیر آسان، رمزینه مناسبی برای بررسی تنوع ژنتیکی گونه های پلاخور است.

کلمات کلیدی:
Barcode regions, Phylogeny, Molecular marker, Honeysuckle, نواحی رمزینه, فیلوژنی, نشانگر مولکولی, امین الدوله

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1462021/