بررسی تنوع ژنتیکی و شناسایی نشانه های ردپای انتخاب در چهار نژاد اصلی اسب ایرانی
عنوان مقاله: بررسی تنوع ژنتیکی و شناسایی نشانه های ردپای انتخاب در چهار نژاد اصلی اسب ایرانی
شناسه ملی مقاله: JR_JOAGK-15-2_002
منتشر شده در در سال 1402
شناسه ملی مقاله: JR_JOAGK-15-2_002
منتشر شده در در سال 1402
مشخصات نویسندگان مقاله:
سیده فاطمه موسوی - دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران
محمد رزم کبیر - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران.
جلال رستم زاده - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان، سنندج
حمیدرضا سیدآبادی - موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، کرج، ایران
خلاصه مقاله:
سیده فاطمه موسوی - دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران
محمد رزم کبیر - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران.
جلال رستم زاده - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان، سنندج
حمیدرضا سیدآبادی - موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، کرج، ایران
هدف: انتخابهای طبیعی و مصنوعی باعث تغییر در فراوانی آللی در بین جمعیتها شده و به صورت مداوم الگوهای قابل شناسایی را بر روی سطح ژنوم طی فرآیند اهلیسازی برجای میگذارند. اطلاعات کمی در خصوص تفاوتهای ساختارهای ژنتیکی در نژادهای اسب بومی ایران که منتج از فشارهای انتخابی هستند وجود دارد. بنابراین، در این مطالعه با استفاده از اطلاعات چهار نژاد اسب بومی شامل ترکمن (۲۹ نمونه)، کاسپین (۲۱ نمونه)، کرد (۶۷ نمونه) و اصیل ایرانی (۵۲ نمونه) به بررسی تنوع ژنتیکی پرداخته شد. مواد و روش ها: برای این منظور سه روش تجزیه مولفه های اصلی (PCA)، پیوستگی مجاور (NJ) و اختلاط جمعیتی مورد بررسی قرار گرفت. در ادامه با کمک ادغام سه روش مختلف شناسایی نشانههای انتخاب شامل TajimaD، تنوع نوکلئوتیدی (pi) و درجه هاپلوتایپی یکپارچه (iHS) اقدام به شناسایی ردپاهای انتخاب در این نژادها گردید. برای ادغام نتایج مختلف این سه روش، از چهارچوب ترکیب همبسته سیگنال های چند گانه استفاده گردید. نتایج: تمام روش های مورد استفاده برای بررسی ساختار ژنتیکی، به خوبی این چهار نژاد را از هم جدا نموده و یک الگوی مرتبط با منشاء جغرافیایی را برای تنوع ژنتیکی آنها نشان داد. با ترکیب روشهای مختلف شناسایی نشانههای انتخاب، تعداد زیادی از ژنهای تحت تاثیر فشار انتخاب در هر چهار نژاد شناسایی گردید. این ژنها با مسیرهای خاص GO و نواحی مرتبط با QTL در ارتباط بودند. تعداد ۱۶ ژن مشترک در بین چهار نژاد به عنوان ژن های کاندید انتخاب شناسایی گردید. بعلاوه، در هر چهار نژاد تحت بررسی تعداد ۱۱ نوع QTL مشترک شناسایی گردید که به دسته صفات مرتبط با سازگاری، شایستگی از طریق نقصهای ژنتیکی و یا رفتاری و ظاهری قابل تقسیم بودند. نتیجه گیری: در مجموع نتایج بدست آمده در این تحقیق می تواند در درک بهتر فرآیند انتخاب طبیعی و مصنوعی در اسبهای ایران کمک نماید. همچنین این تحقیق به درک بهتر تفاوتهای ژنتیکی بین نژادهای اسب بومی ایران کمک نموده که می تواند در یافتن بهترین راه حل برای حفظ و بهبود تنوع ژنتیکی کمک شایانی نماید.
کلمات کلیدی: نشانه های انتخاب, اسب اصیل, اسب کاسپین, اسب ترکمن, اسب کرد
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1676648/