CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های بومی جو وحشی H. Spontaneum با استفاده از نشانگر مولکولی EST-SSR

عنوان مقاله: بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های بومی جو وحشی H. Spontaneum با استفاده از نشانگر مولکولی EST-SSR
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-15-45_004
منتشر شده در در سال 1402
مشخصات نویسندگان مقاله:

هومن شیروانی - Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Ilam University, Iran
علی اشرف مهرابی - Ilam University and , Agricultural Research, Education and Extension Organization, Tehran, Iran
محسن فرشادفر - Department of Agriculture, Payame Noor University, Tehran, Iran
هوشمند صفری - of Forests and Rangelands Research Department, Agricultural Research and Training Center and Kermanshah Province, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Kermanshah, Iran
علی آرمینیان - Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Ilam University, Iran
فواد فاتحی - Department of Agriculture, Payame Noor University, Tehran, Iran

خلاصه مقاله:
چکیده مبسوط مقدمه و هدف: تنوع ژنتیکی گونه­ های وحشی مرتبط با خزانه ژنی اولیه جو  برای بهره ­برداری در برنامه­ های اصلاحی بسیار حائز اهمیت است. جو زراعی (H. vulgar) و جد زراعی آن (H. spontaneum) سیستم مدل عالی و اقتصادی برای بررسی، اکتشاف و بهره­ برداری ژنتیکی می ­باشند. در تحقیق پیش­رو تنوع ژنتیکی ۱۱۴ توده بومی جو وحشی جمع­ آوری شده از غرب کشور، توسط نشانگر مولکولی EST-SSR مورد بررسی قرار گرفته است که هدف بررسی میزان تنوع ژنتیکی این ژنوتیپ­ های بومی و ارزیابی کارایی این نشانگر در تعیین میزان تنوع ژنتیکی موجود در ژنوتیپ­ ها می­ باشد. مواد و روش ­ها: ابتدا به منظور استخراج DNA بذور در گلدان کشت گردید، استخراج DNA به ­روش CTAB تغییر یافته برای هر ژنوتیپ انجام شد. واکنش زنجیره­ای پلیمراز (PCR) در حجم ۲۰ میکرولیتر انجام گرفت. محصول PCR جهت نمایان شده قطعات تکثیری در ژل آگارز ۴ درصد با بافر واکنش TBE یک درصد و رنگ Safe View تزریق گردید. به­ منظور انجام تجزیه و تحلیل­های آماری، داده­ های حاصل در قالب ماتریسی آماده شد و پارامترهای مرتبط با آغازگرها و جمعیت­ ها ارزیابی گردید. یافته­ ها: تعداد الل­ های تکثیر شده از ۲ تا ۴ الل برای نشانگرها متفاوت بود و آغازگرهای مورد بررسی در مجموع ۴۰ الل در ژنوتیپ­ های مورد بررسی با میانگین ۲/۸۵ به ازای هر نشانگر تکثیر کردند. متوسط درصد چند شکلی برای آغازگرهای مورد مطالعه برابر با ۹۶/۴۲ درصد بود. محتوی اطلاعات چند شکلی (PIC) از ۰/۳۹۷ تا ۰/۱۸۹ متغیر بود. نتایج نشان داد که بیشترین سطح تنوع در جمعیت­ های استان لرستان و کمترین تنوع در جمعیت­ های استان کردستان وجود دارد. دندرو­گرام حاصل از تجزیه خوشه ­ای ژنوتیپ ­ها را در ۱۴ گروه قرار داد که بر اساس گروه بندی تنوع ژنتیکی تا حدودی با پراکنش جغرافیایی تطبیق داشت. همچنین نتایج تجزیه به مختصات اصلی تا حدودی با تجزیه خوش ه­ای مطابقت داشت. نتیجه­ گیری: نتایج نشان داد تنوع خوبی در میان جمعیت­ های مورد بررسی وجود دارد. همچنین چند شکلی مناسبی نیز در بین آغازگرها مشاهده گردید. آغازگرهای GBM۱۲۲۱ با ۳ الل، GBM۱۴۶۱ با ۳ الل و SCSSR۰۴۱۶۳ با ۴ الل که بهترین چند شکلی را داشتند، به­ عنوان آغازگرهای برتر به­ منظور استفاده در تحقیقات بعدی جو معرفی می­گردند. وجود تنوع ژنتیکی بالا در جمعیت های طبیعی جو وحشی H. spontaneum نشان می دهد که ژرم پلاسم این گیاه را می توان در رویشگاه­های طبیعی حفاظت نمود. همچنین این تنوع منبع ارزشمندی برای شناسایی نشانگرهای مولکولی آگاهی بخش برای صفات مختلف فنوتیپی است.

کلمات کلیدی:
Diversity, Genetic structure, Molecular markers, Wild Barleyre, تنوع, جو وحشی, ساختار ژنتیکی, نشانگر مولکولی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1687169/