CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

آنالیز منحنی ذوب DNA با کیفیت بالا (HRM) به منظور شناسایی استافیلوکوک اورئوس و سویه مقاوم به متی سیلین

عنوان مقاله: آنالیز منحنی ذوب DNA با کیفیت بالا (HRM) به منظور شناسایی استافیلوکوک اورئوس و سویه مقاوم به متی سیلین
شناسه ملی مقاله: JR_JMUMS-28-167_008
منتشر شده در در سال 1397
مشخصات نویسندگان مقاله:

حامد طهماسبی - MSc in Medical Micobiology, Faculty of Medicine, Zahedan University of Medical Sciences, Zahedan, Iran
ساناز ده باشی - PhD Student in Medical Bacteriology Faculty of Medicine, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
محمد رضا عربستانی - Associate Professor, Department of Microbiology, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran Brucellosis Research Center, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran

خلاصه مقاله:
سابقه و هدف: آنالیز منحنی ذوب DNA با کیفیت بالا (HRM) یکی از حساس ترین و دقیق ترین روش ها جهت شناسایی استافیلوکوک اورئوس و مقاومت به متی سیلین است. این مطالعه با هدف آنالیز منحنی ذوب DNA با کیفیت بالا، به منظور شناسایی سویه های استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین انجام پذیرفت. مواد و روش ها: در این مطالعه تجربی، از سویه های استاندارد استافیلوکوک اورئوس ATCC۲۵۹۲۳ و ATCC ۳۳۵۹۲ استفاده شد. جهت شناسایی استافیلوکوک اورئوس از ژن ITS، و مقاومت به متی سیلین از ژن mecA استفاده گردید. با استفاده از نرم افزارهای StepOne Software v۲.۳ و HRM Software v۳.۰.۱ تجزیه و تحلیل انجام شد و نتایج تعیین توالی به عنوان گلد استاندارد مورد استفاده قرار گرفت. یافته ها: حساسیت آنالیتیکی روش PCR با استفاده از پرایمر ITS قادر به شناسایی CFU ۱۰۴ باکتری بوده و برای ژن mecA تا CFU ۱۰۳ باکتری را تشخیص داد. حسایت آنالیتیکی روش HRM نیز برای پرایمر ژن ITS تا رقت CFU ۲-۱۰ و پرایمر ژن mecA تا رقت CFU ۵-۱۰ قدرت شناسایی باکتری را داشته است. در تجزیه و تحلیل نتایج HRM نیز کم ترین مقدار خطا در منحنی ها ذوب DNA مشاهده گردید به طوری که، با در نظر گرفتن نزدیک ترین بازه دمایی به منظور تجزیه و تحلیل، دمای ذوب برای ژن ITS مقدار ۵/۰± ۸۶ درجه سلسیوس و برای ژن mecA مقدار ۵/۰± ۸۱ درجه سلسیوس به دست آمد. نتایج دما و تعیین توالی اختصاصیت بالای روش HRM را نشان داد. استنتاج: روش HRM از نظر تشخیص مقدار کم باکتری، دارای حساسیت و اختصاصیت بالایی می باشد.

کلمات کلیدی:
Staphylococcus aureus, Methicillin resistance, DNA Melting Curve, HRM, استافیلوکوک اورئوس, مقاومت به متی سیلین, منحنی ذوب DNA, HRM

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1786078/