CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

آنالیز بیوانفورماتیکی پروفایل های بیان افتراقی ژنی مرتبط با استرس گرمایی در سه بافت مغز، کبد و ماهیچه ران جوجه های گوشتی مبتنی بر تکنیک ریزآرایه

عنوان مقاله: آنالیز بیوانفورماتیکی پروفایل های بیان افتراقی ژنی مرتبط با استرس گرمایی در سه بافت مغز، کبد و ماهیچه ران جوجه های گوشتی مبتنی بر تکنیک ریزآرایه
شناسه ملی مقاله: JR_IJAS-54-3_001
منتشر شده در در سال 1402
مشخصات نویسندگان مقاله:

محمد سلیمان اختیاری - گروه علوم پایه، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
آرش جوانمرد - گروه مهندسی علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
فرزاد غفوری - گروه مهندسی علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
آیه سادات صدر - موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش، اهواز، ایران
سیدرضا میرائی آشتیانی - گروه مهندسی علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران.
مسعود شیرعلی - موسسه تحقیقات کشاورزی، غذا و علوم زیستی، هیلزبرا، انگلستان و استادیار دانشگاه بلفست، بلفست، انگستان

خلاصه مقاله:
در صنعت پرورش طیور، استرس گرمایی ناشی از دمای بالای محیط، بر عملکرد حیوانات تاثیر منفی دارد و به یک چالش اساسی تبدیل شده است. آنالیز پروفایل ترانسکریپتوم داده ها و شناسایی الگوهای بیان افتراقی ژن در بافت های مرتبط می تواند در کشف سازوکارهای مولکولی مقاوم به استرس حرارتی نقش داشته باشد. در پژوهش حاضر، هدف اصلی استفاده از پروفایل ترانسکریپتوم سه بافت مغز، کبد و ماهیچه ران دو دسته از جوجه های گوشتی گروه کنترل و گروه تحت استرس گرمایی، بمنظور شناسایی ژن های کاندیدای مرتبط با استرس گرمایی است. در تجزیه داده های ریزآرایه برای مقایسه بیان ژنی، ۶۵۷ ژن معنی دار (P<۰.۰۵) استخراج شد که در مجموع ۹۴ ژن تفاوت بیانی معنی داری نشان دادند (FDR < ۰.۰۵, Fold change > ±۲). سپس با بررسی حاشیه نویسی ژن های مربوطه حاصل از آنالیز داده ها و مرور منابع و همچنین شبکه تعاملی پروتئین- پروتئین بازسازی شده، ژن های هاب شامل ژن های NSDHL، DHCR۲۴، LSS، FDPS، PCK۱، ACTA۱، HSP۹۰AA۱، HSPA۲، HSPB۱، HSF۱، CRYAB، APOB و IL۶ شناسایی شدند. بررسی نتایج حاشیه نویسی این ژن ها ثابت کرد که در فرآیند اصلی مسیرهای متابولیک و سیگنالینگ مرتبط با سیستم حمل و نقل یونی، بیوسنتز استروئیدها، آنتی بادی ها و کلسترول، متابولیسم لیپیدها، عملکرد سیستم ایمنی بدن و مسیرهای سیگنالی مختلف مانند کیناز MAP، RET  و ERK دارای نقش می باشند. در نهایت پژوهش حاضر می تواند افق جدیدی از شواهد را با در نظر گرفتن مسیرهای فعال شده توسط این ژن ها برای شناسایی ژن های موثر و درک بهتر فرآیندهای زیستی مرتبط با تنش گرمایی ارائه دهد.

کلمات کلیدی:
استرس گرمایی, بیان ژن, جوجه های گوشتی, ژن های هاب, سیستم بیولوژی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1803562/