CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

طراحی مدل های پیش بینی جهت تعیین ساختارارگانیزمی آنزیم استریول اسیل کریر پروتئین دیسچوراز

عنوان مقاله: طراحی مدل های پیش بینی جهت تعیین ساختارارگانیزمی آنزیم استریول اسیل کریر پروتئین دیسچوراز
شناسه ملی مقاله: AGRIBIOTECH03_047
منتشر شده در سومین همایش ملی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (گیاهی، دامی و صنعتی) در سال 1391
مشخصات نویسندگان مقاله:

علی سالاری - دانشجوی کارشناسی زیست شناسی دانشگاه پیام نور
مرتضی رضوی - دانشجوی کارشناسی زیست شناسی دانشگاه پیام نور قم
منصور ابراهیمی - گروه پژوهشی بیوانفورماتیک، پژوهشکده سبز دانشگاه قم

خلاصه مقاله:
اسید های چرب به زنجیره ای گفته می شود که در یک انتهای آن کربوکسیل قرار داشته و به دو دسته ی اسید چرب اشباع و غیر اشباع طبقه بندی می شوند. بیشتر اسیدهای چرب غیر اشباع براساس موقعیت اولین پیوند دوگانه شان به امگا - 3 ، 6 و 9 تقسیم بندی می شوند. هدف: پیدا کردن مهمترین مولفه های ژنی اختصاصی ارگانیزمی آنزیم استریول اسیل کریر پروتئین دیسچوراز (S-ACP-DES با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و طراحی مدلهای پیش بینی (برای اولین بار) جهت تعیین ارگانیزمهای این آنزیم ها می باشد. روش: روش کار توسط ابزار های متفاوت بیوانفورماتیکی و نرم افزار هایی مانند CLC Bio software می باشد که تعداد 28 مشخصه ی ژنی را از نظر تعداد، تکرار نوکلئوتیدها و عناصر متفاوت ژن ها مورد محاسبه قرار می دهد. همچنین توسط برنامه Rapidminer با استفاده از مدلهای مختلف وزن دهی، درخت های تصمیم گیری و همچنین دسته بندی متغیرهای ژنی براساس میزان اهمیت، استخراج می کند. برای اولین بار طراحی مدلهای یادگیری برای پیش بینی ارگانیزمهای آنزیمی بر اساس متغیرهای ژنی صورت گرفت. نتیجه: مهمترین متغیر ژنی در تشخیص ساختارهای ارگانیزمی آنزیم (S-ACP-DES فراوانی طول بوده است. همچنین مدل های پیش بینی طراحی شده نشان دادند که مدل Naive Bayse با معیار FCdb با دقت 97.83% می تواند ارگانیزم آنزیم های جدید را بر اساس خصوصیات ژنی پیش بینی نماید. دو یافته فوق برای اولین بار در این مطالعه گزارش می شوند.

کلمات کلیدی:
stearoyl-acyl carrier protein-desaturase ، امگا ٣ ،S-ACP-DES

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/204099/