سمیرا رهیده - دانشجوی کارشناسی ارشد دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران، ایران
حمید عبداللهی - دانشیار بخش تحقیقات باغبانی، موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، کرج
غلامرضا صالحی جوزانی - استادیار بخش تحقیقات بیوتکنولوژی میکروبی و ایمنی زیستی، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج

یکی از نواحی بسیار مهم باکتری عامل آتشک، E. amylovora، در فرآیند بیماریزایی، بخشی به طول تقریبی 40 کیلو باز از ژنوم کروموزومی، بهنام خوشه ژنی هارپین بوده که عامل ایجاد بیماری در گیاهان میزبان، تحریک واکنش فوق حساسیت در گیاهان غیرمیزبان، تراوش سلولی و تولید پروتئینهای هارپین می باشد. در تحقیق حاضر تنوع ژنتیکی جدایه های مختلف باکتری E. amylovora با پراکنش جغرافیایی در بخشهایی از خوشه ژنی هارپین با استفاده از روش PCR-RFLP مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور با یافتن نواحی جداکننده بین ژنی و نیز تعیین ژنهای اصلی این خوشه به عنوان بخشهای حفاظت شده، اقدام به طراحی سه جفت آغازگر دربرگیرنده فواصل بین ژنی شامل جفت آغازگرهای HRPL, HRPW و HRCU گردید. DNA ژنومی جدایه ها استخراج و مورد ارزیابی کمی و کیفی قرار گرفتند. پس از انجام واکنش PCR و تولید محصولات، آزیمهای محدودگر MboI, TaqI, AluI, PstI, و Bg/II به عنوان آنزیمهای تأثیر گذار بر روی توالی تکثیر شده انتخاب و هضم کامل آنزیمی صورت گرفت. نتایج حاصل عدم وجود تفاوت و تنوع در بخش ژنی مورد نظر، چه در تولید محصولات PCR و چه در طول قطعات حاصل از هضم با آنزیم را به اثبات رساند.

بیماری آتشک، تنوع ژنتیکی، خوشه ژنی hrp