محمد مداحیان - دانشجوی سابق کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی دانشگاه شهید باهنر کرمان
حسین معصومی - عضو هیئت علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان
جهانگیر حیدرنژاد - عضو هیئت علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان
اکبر حسینی پور - عضو هیئت علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان

به منظور مطالعه ژنوم ویروس بی بذری گوجه فرنگی (Tomato aspermy virus, TAV) و مقایسه قطعه RNA-1 جدایه ایرانی این ویروس با دیگر جدایه های گزارش شده در دنیا، طی نمونه برداری از مناطق مختلف کشور در سالهای 1388 تا 1389 آلودگی یک نمونه گیاه اطلسی نسبت به این ویروس در منطقه ماهان استان کرامن به وسیله آزمون الایزا به روش ساندویچ دوطرفه با آنتی سرم چند همساننه ای تأئید شد. آر.ان.ای کل ویروس استخراج و قطعه RNA-1 و ژن 1a این جدایه (Ker.Mah.P) توسط 4 جفت آغازگر اختصاصی در روش RT-PCR تکثیر و سپس همسانه سازی گردیدند. پس از تعیین ترادف، طول قطعه RNA-1 و ژن 1a این جدایه ایرانی به ترتیب معادل 3351 و 2981 نوکلئوتید بدست آمد. جهت تعیین جایگاه تکاملی جدایه Ker.Mah.P با دیگر ترادفهای موجود در بانک ژن مورد مقایسه قرار گردیدند. بر اساس درخت تکاملی رسم شده بر پایه ژن 1a جدایه Ker.Mah.P به همراه جدایه های KC-TAV و V-TAV مربوط به کشورهای استرالیا و کره جنوبی به ترتیب با 99/. و 99/2 درصد بیشرین میزان مشابهت را با جدایه ایرانی نشان دادند. همچنین جدایه Ker.Mah.P با 99/2 درصد دارای بیشترین میزان تشابه ترادف نوکلئوتیدی در قطعه RNA-1 با جدایه V-TAV می باشد. نتایج حاصل از این تحقیق تشابه بالای ترادف نوکلئوتیدی و اسیدهای آمینه قطعه RNA-1 و همچنین ژن 1a مربوط به آن را با دیگر جدایه های گزارش شده در دنیا نشان می دهد.

ترادف نوکلئوتیدی، ویروس بی بذری گوجه فرنگی، ژن 1a