طراحی مدل های پیش بینی جهت تعیین ساختار ارگانیزمی آنزیم استریول کوآنزیم آ دی سچوراز
عنوان مقاله: طراحی مدل های پیش بینی جهت تعیین ساختار ارگانیزمی آنزیم استریول کوآنزیم آ دی سچوراز
شناسه ملی مقاله: CIGS12_1080
منتشر شده در دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران در سال 1391
شناسه ملی مقاله: CIGS12_1080
منتشر شده در دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران در سال 1391
مشخصات نویسندگان مقاله:
سیدمرتضی رضوی - دانشجوی کارشناسی زیست شناسی دانشگاه پیام نور قم
علی سالاری - دانشجوی کارشناسی زیست شناسی دانشگاه پیام نور قم
منصور ابراهیمی - روه پژوهشی بیوانفورماتیک، پژوهشکده سبز دانشگاه قم
خلاصه مقاله:
سیدمرتضی رضوی - دانشجوی کارشناسی زیست شناسی دانشگاه پیام نور قم
علی سالاری - دانشجوی کارشناسی زیست شناسی دانشگاه پیام نور قم
منصور ابراهیمی - روه پژوهشی بیوانفورماتیک، پژوهشکده سبز دانشگاه قم
آنزیم استریول کوآنزیم آ، آنزیمی دی سچوراز یا غیر اشباع کننده است که باعث اضافه شدن اولین پیوند دوگانه به زنجیره اسید چرب 18 کربنه ی امگا 3 و یا امگا 6 می شود. اسیدهای چرب امگا 3 باعث افزایش زمان خونریزی می شوند که به علت کاهش تجمع پلاکت ها، افزایش سیالیت خون و فیبروژن ها و افزایش شکل پذیری و انعطاف گلبول های قرمز ایجاد می شود، در نهایت امگا 3 باعث کاهش انعقاد خون می شود. هدف: پیدا کردن مهمترین مؤلفه های ژنی اختصاصی ارگانیزمی آنزیم (SCD) Stearyol Co-A Desaturase با استفاده از ابزارهای بیو انفورماتیکی و طراحی مدلهای پیش بینی جهت تعیین ا رگانیزمهای این آنزیم ها می باشد. روش: با استفاده از ابزارهای مدلسازی و برنامه های مختلف داده کاوی نسبت به طراحی بانک اطلاعاتی از متغیرهای ژنی حدود 763 فستای ژنی آنزیمهای فوق در گونه های مختلف اقدام شده و سپس با استفاده از مدلهای وزن دهی، درخت های تصمیم گیری و روشهای دسته بندی نسبت به شناسایی مهمترین متغیرها اقدام شد. در نهایت برای اولین بار طراحی مدل های پیش بینی نوع ارگانیزم براساس متغیرهای ژنی انجام شد. نتیجه: مهمترین متغیر ژنی در تشخیص ساختارهای ارگانیزمی آنزیم SCD، مولفه ی طول رشته ی نوکلئوتیدی بوده است. همچنین مدلهای پیش بینی طراحی شده نشان دادند که مدل شبکه ی عصبی (Neural Net) با دقت 89.26% می تواند ارگانیزم آنزیمهای جدید را براساس خصوصیات ژنی پیش بینی نماید.
کلمات کلیدی: ؛Stearyol Co-A Desaturase، استریول کوآنزیم آ دی سچوراز، SCD و امگا 3
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/227346/