CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

آنالیز فیلوژنی مولکولی اعضای قبیله Eritrichieae از خانواده گاوزبان بر اساس توالی کلروپلاستی psbA- trnH

عنوان مقاله: آنالیز فیلوژنی مولکولی اعضای قبیله Eritrichieae از خانواده گاوزبان بر اساس توالی کلروپلاستی psbA- trnH
شناسه ملی مقاله: IBIS04_027
منتشر شده در چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران در سال 1391
مشخصات نویسندگان مقاله:

مریم خوش سخن مظفر - دانشگاه آزاد اسلامی واحد قم، گروه زیست شناسی، قم، ایران
شاهرخ کاظم پور او صالو - دانشگاه تربیت مدرس، دانشکده علوم زیستی، گروه علوم گیاهی، تهران، ایران
عاطفه امیر احمدی - دانشگاه تربیت مدرس، دانشکده علوم زیستی، گروه علوم گیاهی، تهران، ایران
رقیه اسکوئیان - گروه زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد آیت الله آملی، آمل

خلاصه مقاله:
قبیله Eritrichieae متعلق به خانواده گاوزبان بوده و دارای 62 گونه در ایران می باشد. در تحقیق حاضر از توالی نوکلئوتیدیtrnH- psbA جهت تعیین موقعیت تاکسونومیکی این قبیله استفاده گردید. از مزایای توالی مذکوراین است که از نمونه هایهرباریومی با محتوای ژنومی خرد شده به راحتی قابل تکثیر است و به دلیل نرخ بالای جانشینی به عنوان اولین توالی برایDNA نشانگرمطرح شده است. در این پژوهش ابتدا DNA کل از برگ نمونه های گیاهی استخراج شده و سپس قطعه ی ژنیpsbA- trnH با استفاده از دستگاه ترموسیکلر تکثیر شد. پس از چک کردن کمیت و کیفیت قطعه با الکتروفورز، محصولاتPCR جهت توالی یابی فرستاده خواهند شد. سپس هم ردیف سازی توالی های انجام شده با برنامه MUSCLE یا Clustal X انجام گرفته و به دنبال آن جهت نشان دادن قرابت گونه ها ،آنالیز فیلوژنی با نرم افزار های نظیر RAxML ،MrBayes ، PAUP انجام گرفت. نتایج نشان داد قبیله مذکور تک تبار نمی باشد. گونهAsperugo procumbens در قاعده درخت قرار می گیرد، دو جنس Heterocaryum و Rochelia تک تبارند ولی جنس های Lappula و Lepechiniella تک تبار نیستند. گونه های جنس Lepechiniella توالی های نوکلئوتیدی مشابه با Lappula microcarpa وL. barbata نشان دادند

کلمات کلیدی:
RAxML ، MrBayes ، Paup ، Eritrichieae قبیله

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/287582/