CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

ساخت یک محیط محاسبات شبکه ای برای بیوانفورماتیک

عنوان مقاله: ساخت یک محیط محاسبات شبکه ای برای بیوانفورماتیک
شناسه ملی مقاله: IBIS04_042
منتشر شده در چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران در سال 1391
مشخصات نویسندگان مقاله:

فرزین خسروی دانش - کارشناسی ارشد علوم کامپیوتر ، کارشناسی علوم آزمایشگاهی
نغمه عسگری - کارشناسی مهندسی نرم افزار
ایاز عیسی ز اده
جابر کریم پور

خلاصه مقاله:
محاسبات اینترنتی و فناوری های شبکه ای برای تغییر راه مقابله با مسائل پیچیده وعده می دهند. آنها اجتماع مقیاس بزرگی و اشتراک گذاری محاسباتی،داده ها و سایر منابع در سرتاسر مرزهای سازمانی را فعال خواهند کرد. و بهره برداری از این فناوری های جدید بطور موثر رشته های علمی اعم از فیزیک رابه علوم زندگی تبدیل خواهد کرد. تجزیه و تحلیل از توالی زیستی، نوعی از علوم محوری محاسباتی است. بخاطر اینکه دادههای زیست شناسی به سرعت درحال رشد هستند، این پایگاه داده های ناهمگن هستند. ما می توانیم از سیستم های شبکه ای برای اشتراک گذاری و یکپارچه سازی پایگاه دادههای بیولوژی ناهمگن استفاده کنیم. همان طور که می دانید، ابزارهای بیوانفورماتیک می تواند به تجزیه و تحلیل اطلاعات توالی در اندازه های بزرگ، بخوصوص در موردترتیب توالی، سرعت بخشد. FASTA ابزاری برای تنظیم پروتئین های مختلف و یا توالی نوکلئوتید است. FASTA یک نسخه توزیع شده و موازی است که ما استفاده می کنیم. این نرم افزار با استفاده از یک کتابخانه عبور پیام بنام MPI (رابط عبور پیام) و روی خوشه های ایستگاه کاری توزیع شده و به همان اندازه کامپیوتر های موازی سنتی اجرا می شود.

کلمات کلیدی:
، محاسبات شبکه، محاسبات خوشه ای، بیوانفورماتیک.FASTA

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/287597/