ناهید گرایلی - گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
ساره بقایی راوری - گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

روش های مختلف فنوتیپی، مولکولی و فیلوژنی برای تشخیص و گروه بندی زیر گونهPectobacterium carotovorum subsp. Carotovorum استفاده شده است که در بسیاری موارد حاکی از تنوع ژنتیکی بالا در اعضای این زیر گونه می باشدجایگاه ژنیpmrAمتعلق به سیستم دو جزئیPmrA-PmrBبرای مقاومت باکتری به آنتی بیوتیک های پپتیدی و سایرپپتیدهای ضد میکروبی مشتق شده از گیاه ضروری می باشد و برای بقاء باکتری تحت شرایط متنوع محیطی لازم می باشد.این ژن در تمامی اعضای اینتروباکتریاسه وجود دارد و می تواند به عنوان یک شاخص در تفکیک زیر گونه Pccعمل نماید.بررسی حاضر 18 جدایه پکتولیتیک ایرانی بدست آمده از کاکتوس هایHaworthia و Opuntia و Chamaecereusگلخانه های خراسان رضوی و مرکزی بر اساس آزمونهای فنوتیپی وPCRاختصاصی با آغازگرهایEXPCCFوEXPCCRمتعلق به زیر گونهPccمی باشند. آزمون بیماریزایی درجات مختلفی از پوسیدگی نرم را نشان داده است. براساس آنالیز تعیین توالی ژنpmrAتمام جدایه های بدست آمده از کاکتوس همراه با جدایهPccثبت شده در بانک ژن دریک گروه قرار گرفتند . به نظر می رسد ژنpmrAبه لحاظ حفظ شدگی، تک کپی بودن و راحتی تکثیر می تواند جهت شناسایی و بررسی تنوع زیر گونهPccاز میزبانهای مختلف استفاده گردد

آنالیز فیلوژنیک، پکتوباکتریوم، کاکتوس، ژنpmrA