زینب امیری قنات سامان - دانشجوی دکتری اصلاح نژاد دام، بخش مهندسی علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان،کرمان، ایران و عضو انجمن پژوهشگران جوان، دانشگاه شهید باهنر کرمان
علی اسمعیل زاده کشکوییه - استادبخش مهندسی علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران
مسعود اسدی فوزی - دانشیاربخش مهندسی علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران

در این پژوهش، از سه قلاده سگ و سه قلاده گرگ بومی ایران نمونهگیری شد. توالییابی کل ژنگان )ژنوم( برای هر نمونه سگ و گرگ با استفاده از روش توالی یابی نسل جدید انجام شد. دادهها توسط برنامه BWA با ژنگان مرجع )رفرنس( همردیف شدند. چندریختی های تکنوکلیوتیدی و حذف و اضافههای کوچک ژنگان با برنامه GATK شناسایی شدند . تغییرپذیری)واریانت(های ساختاری با برنامه BreakDancer-1.1 تعیین شدند. مستندسازی چندریختیهای تکنوکلیوتیدی و حذف و اضافههای کوچک ژنگان با برنامه SnpEff انجام شد. مقادیر تنوع نوکلیوتیدی در نمونههای سگ و گرگ با VCFtools محاسبه شدند. در این پژوهش 12113611چندریختی تک نوکلیوتیدی به دست آمد که 1213123 و 19111331 به ترتیب مربوط به نمونه های سگ و گرگ بودند.از شمار کل چندریختیهای تک نوکلیوتیدی 31 و /323 ،13/ 119/211 درصد به ترتیب در ناحیه بین ژنی، اینترون و اگزون قرار گرفتند. نتایج تجزیه وتحلیل داده ها نشان داد که تنوع ساختاری در ژنگان گرگ بیشتر از سگ است.

تغییرپذیری ساختاری، حذف و اضافه کوچک، چندریختی تک نوکلیوتیدی