مجید صیام پور - عضو هیات علمی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد

فیتوپلاسماها شامل پروکاریوتهای بیماریزای گیاهی هستند. در این مطالعه دو ژن مربوط به پروتیینهای غشایی در چند فیتوپلاسمای متعلق به گروه 16srII شامل فیتوپلاسماهای جاروک لیموترش، جاروک یونجه جدایه های فارس و سیستان و فیلودی خیار بررسی شد. با طراحی آغازگر، ژنهای مربوط به پروتیین اصلی غشاء ) Imp ( و پروتیین غشایی دیگر ) IntImp (در هر 4 فیتوپلاسما تکثیر و ترادف آنها تعیین شد. آنالیزهای انجام شده نشان داد که Imp دارای یک ناحیه تراغشایی به اندازه 20 آمینو اسید است. 20 آمینواسید اول این پروتیین در داخل سیتوپلاسم و ناحیه اصلی پروتیین در سمت انتهای 130( C آمینو اسید( در خارج سلول پیش بینی شد. میزان شباهت نوکلیوتیدی زن Imp بین این 4 فیتوپلاسما 79 تا 99 درصد )فیتوپلاسماهای فیلودی خیار و یونجه سیستان( بود. میزان فشار انتخاب) dN/dS ( روی این ژن 8/. بود ) فشار انتخاب منفی(. تعدادی از آمینو اسیدها نیز تحت فشار انتخاب مثبت شناسایی شدند. آنالیزهای مشابه روی ژن IntImp نشان داد که پروتیین محصول این ژن دارای 6 ناحیه تراغشایی است. سمت انتهای N پروتیین IntImp در داخل سیتوپلاسم و انتهای C در خارج سیتوپلاسم بود. میزان تنوع نوکلیوتیدی در ژن مذکور ذر بین فیتوپلاسماهای مورد مطالعه 85 تا 100 درصد بود. میزان فشار انتخاب روی این ژن 0.5 بود و هیچ آمینو اسیدی تحت فشار انتخاب مثبت روی آن شناسایی نشد.با توجه به نتایج مشخص شد که روند تغییرات روی ژنهای غشایی فیتوپلاسماهای گروه 16SrII مشابه نبوده و ژن Imp دارای تنوع بیشتری بوده و برای تفکیک فیتوپلاسماهای نزدیک مناسب تر است. همچنین وجود آمینواسیدهایی تحت فشار انتخاب مثبت روی این ژن نشان از اهمیت بیولوژیکی آن در برهمکنش یا پروتیینهای دیگر دارد.

فیتوپلاسما، پروتتین، غشاء، فشار انتخاب