CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی جایگاه های ژنومی موثر بر طول سرپستانک های جلویی و عقبی گاومیش های استان خوزستان با روش پویش ژنومی

عنوان مقاله: بررسی جایگاه های ژنومی موثر بر طول سرپستانک های جلویی و عقبی گاومیش های استان خوزستان با روش پویش ژنومی
شناسه ملی مقاله: NCIB03_051
منتشر شده در سومین همایش ملی گاومیش در سال 1395
مشخصات نویسندگان مقاله:

محمدرضا زرگر - دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح ن ژاد دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
جمال فیاضی - دانشیار دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
محمدتقی نصیری بیگی - استاد دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
حسین مرادی شهربابک - استادیار دانشگاه تهران

خلاصه مقاله:
هدف از انجام این مطالعه شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با طول سرپستانک های جلویی و عقبی گاومیش های استان خوزستان می باشد در این مطالعه از تعداد 121 نمونه از گاومیش های شهرستان های گاومیش خیز استان خوزستان ازگله هایی که تحت پوشش سیستم ثبت مشخصات و رکورد گیری شیر قرار داشتند نمونه گیری شد. نمونه ها با استفاده از تراشه ژنومی اختصاصی گاومیش با تعداد 90 هزار نشانگر SNP تعیین ژنوتیپ شدند. سپس جایگاه های با حداقل فراوانی آللی (MAF ) کمتر از 0/01، تعادل هاردی واینبرگ آنها کمتر 6-10 و نرخ خوانش آنها کمتر0.05 بود، کنار گذاشته شدند.سپس با استفاده از نرم افزار PLINK ارتباط این صفات با ژنوم گاومیش ها مورد بررسی قرار گرفت و توسط نرم افزار R نمودار منهتن برای این آنها رسم گردید.که نشان می دهد SNP هایی که برروی کروموزوم های 23،19 و30 قرار دارند بر روی طول سرپستانک های جلویی وSNP هایی که بر روی کروموزوم های 7،1 و 26 قرار دارند بر روی طول سرپستانک های عقبی تاثیر دارند.

کلمات کلیدی:
پویش کل ژنومی، گاومیش، تنوع تک نوکلیوتیدی، جایگاه صفات کمی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/738346/