CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی تنوع ژنتیکی و روابط فیلوژنتیکی گیلاس (Prunus avium) با استفاده از ژنهای کلروپلاستی accD-psaI

عنوان مقاله: بررسی تنوع ژنتیکی و روابط فیلوژنتیکی گیلاس (Prunus avium) با استفاده از ژنهای کلروپلاستی accD-psaI
شناسه ملی مقاله: ICPP06_140
منتشر شده در ششمین کنفرانس ملی فیزیولوژی گیاهی ایران در سال 1398
مشخصات نویسندگان مقاله:

مجتبی خیاطیان - دانشجوی کارشناسیارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده منابع طبیعی و کویرشناسی، دانشگاه یزد
آفاق تابنده ساروی - عضو هیئت علمی، دانشکده منابع طبیعی و کویرشناسی، دانشگاه یزد
محمدمهدی حیدری - عضو هیئت علمی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه یزد

خلاصه مقاله:
گیلاس گیاهی دیپلوئید از خانواده Rosaceae و زیرتیره Pronuidae و اکثر ارقام آن خودناسازگار یا دگرناسازگار میباشند. گیلاس شیرین به دلیل ترکیبات فعال زیستی آن با ویژگیهای آنتی اکسیدانی،عموما0 شامل پلی فنولها، ویتامینها، آنتوسیانین ها و کاروتنوئیدها محبوبیت زیادی دارد. با توجه به اینکه در گیاهان، DNA کلروپلاست به آرامی تکامل مییابد و نوترکیبی ژنتیکی در فرکانس های پایین اتفاق میافتد، به همین جهت ما برای تایید و تعیین وجود یا عدم وجود یکی از این نواحی و همچنین بررسی روابط فیلوژنتیک بین توالی گیاه بدست آمده با سایر گیاهان جنس Prunus و برخی گونه های نزدیک، این آزمایش را برای Pr.avium طراحی شد. ژنهای مورد بررسی accD و psaI بودند. ژن accD در مسیر بیوسنتزی اسیدهای چرب دخالت دارد و psaI نیز مربوط به فتوسیستم I است. پس از BLAST پرایمرها و انتخاب جفت پرایمر مورد نظر، سنتز صورت پذیرفت و PCR انجام گرفت. با انجام توالییابی، توالی بدست آمده توسط نرم افزار MEGA-X مورد بررسی قرار گرفت. سپس توالی مورد نظر در پایگاه NCBI، BLAST شد و از مجموع توالیهای بدست آمده، توالیهایی انتخاب شده و پس از Alignment توسط نرمافزار MEGA-X به روش Maximum Likelihood درخت فیلوژنی رسم شد و نتایج نشان داد که نمونه توالییابی شده با ژنوم کلروپلاستی به مشخصات Prunus avium cultivar Summit chloroplast بیشترین قرابت را دارد. همچنین هم ردیفی چندگانه ژن توالی یابی شده نشان از وجود جهش و پلی مورفیسم در برخی نقاط داشت. به صورت کلی میتوان نتیجه گرفت که ژنهای کلروپلاستی accD-psaI در گیاه مورد مطالعه (Prunus avium) وجود داشته و این ژنها تا حدود زیادی همچون سایر گونه های جنس Prunus حفاظت شده اند.

کلمات کلیدی:
گیلاس شیرین، توالییابی، ژن کلروپلاستی، فیلوژنتیک، همردیفی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/998103/