بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت اسب کرد ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 371

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-48-3_003

تاریخ نمایه سازی: 6 خرداد 1399

چکیده مقاله:

در این تحقیق با استفاده از شش نشانگر ریزماهواره (HMS07, HMS03, HMS02, HMS06, ASB02, ASB23) تنوع ژنتیکی درون جمعیت 52 نمونه اسب کرد اصیل که از استان­های کردستان، کرمانشاه، ایلام، آذربایجان غربی، اصفهان، کرمان و همدان به طور تصادفی نمونه گیری شده اند، بررسی شد. از نمونه خون­های گرفته شده DNA به روش نمکی بهینه یافته استخراج شد. واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) برای افزونش قطعه های شش جایگاه ریزماهواره با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی به صورت استاندارد انجام شد. آنگاه محصولات  PCRشش جایگاه روی ژل اکریل آمید 8 درصد، الکتروفورز و رنگ آمیزی شد. جایگاه­ها در جمعیت مورد بررسی، چندشکلی بالایی را نشان دادند. شمار آلل­های مشاهده شده و آلل­های موثر و میزان ناخالصی (هتروزیگوسیتی) مورد انتظار و مشاهده شده و شاخص شانون برای همه جایگاه­ها محاسبه شد. نتایج این تحقیق نشان داد، شمار آلل­های شش جایگاه مورد بررسی، از 4 تا 10 آلل متغیر بودند. بیشترین آلل در جایگاه  HMS07 (ده آلل) و کمترین آلل در جایگاه HMS02 (چهار آلل) مشاهده شد. با توجه به نتایج مشاهده شده، جایگاه­های ریزماهواره مورد استفاده چندشکلی بالایی در جمعیت اسب کرد داشتند و می توان از چندشکلی بالای آن ها در بررسی های بعدی، به ویژه در بررسی های ژنتیک جمعیت استفاده کرد. آلل­ها و دامنه­های آللی جدید در اسب کرد، گویای تفاوت ساختاری جمعیتی آن ها با دیگر نژادهای اسب مورد بررسی در تحقیقات دیگر مانند اسب ترکمن و عرب است.

نویسندگان

مطهره اعلا امجدی

دانشجوی کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

حسن مهربانی یگانه

دانشیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

مصطفی صادقی

دانشیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Azor, P., Valera, M., Gómez, M. D., Goyache, F. & ...
  • Barker, J. S. F., Moore, S. S., Hetzel, D. J. ...
  • Behara, A. M. P., Colling, D. T., Cothran, E. G. ...
  • Emil, G. S., Eduard, C., Mariana, R., Anca, D., Dumitru, ...
  • FAO. (2011). Molecular genetic characterization of animal genetic resources. FAO ...
  • Frankham, R. (1994). Conservation of genetic diversity for animals. 5th ...
  • Javanmiri, E., RostamZade, J. & Rashidi, A. (2010). Evaluation of ...
  • Jemmali, B., Haddad, M. M. ,  Barhoumi , N.,  Tounsi, ...
  • Khanshour, A., Conant, E., Juras, R. & Cothran, E. G. ...
  • Kusza, S., Priskin, K., Ivankovic, A., Jedrzejewska, B., Podgorski, T., ...
  • Lee, S. Y. & Cho, G. J. (2006). Parentage testing ...
  • Max Mallowan. (1985). Cyrus the Great.  in  Ilya  Gershevitch ,  ...
  • Ministry of jihad Agriculture, Agricultural research and education organization, Animal ...
  • Moravcikova, N., Kasarda, R., Kukuckova, V., Vostry, L. & Kadleclk, ...
  • Nei, M. 1978.   Estimation  of   average   heterozygosity  and  genetic  distance  ...
  • Orians, G. H. (1990).  The Preservation and valuation of biological ...
  • Shahsavarani, H. & Rahimi-Mianji, G. (2010).  Analysis of genetic diversity ...
  • Silva, A. C. M., Paiva, S. R., Albuquerque, M. S. ...
  • Vahdani Manaf, M. A., Mashayekhi, M. R., Hasanpour, A., Ayubi, ...
  • نمایش کامل مراجع