تخمین هاپلوتایپ با استفاده از ریلکسسازی بهینهسازی چندجملهای
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 278
فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_TJEE-50-2_030
تاریخ نمایه سازی: 4 آذر 1399
چکیده مقاله:
این مقاله به بررسی تخمین هاپلوتایپ با استفاده از دادههای توالی DNA میپردازد. الگوریتم پیشنهادی با استفاده از ریلکسسازی بهینهسازی چندجملهای به روش Lasserre با نام HapLas معرفی میشود. این الگوریتم برپایه استفاده از ساختار گسسته مساله بهینهسازی تخمین هاپلوتایپ میباشد که با استفاده از تئوری اندازه به یک فضای پیوسته نگاشت میگردد. سپس با استفاده از خواص ماتریس ممان، ریلکسسازی انجام میگیرد. نتایج شبیهسازی نشان میدهد که استفاده از الگوریتم پیشنهادی منجر به بهبود نرخ بازسازی هاپلوتایپ در مقایسه با الگوریتمهای متداولSDhaP و RefHap در حدود 5 درصد میگردد. این بهبود بهازای افزایش قابل ملاحظه زمان اجرا و پیچیدگی محاسبات حاصل میشود بهطوری که در کاربردهای پزشکی قابل صرفنظرکردن است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سینا مجیدیان
دانشکده مهندسی برق- دانشگاه علم و صنعت ایران
محمدحسین کهایی
دانشکده مهندسی برق- دانشگاه علم و صنعت ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :