ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

مطالعه اثر ناحیه ژنومی حامل ژن Hd1 بر زمان خوشه دهی در برنج

محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 6، شماره: 3
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 189

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1127695

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-6-3_002

تاریخ نمایه سازی: 15 آذر 1399

چکیده مقاله:

عبور از مرحله رویشی به مرحله زایشی موجب تنظیم زمان خوشه­دهی در برنج می­گردد که از صفات مرتبط با سازگاری این گیاه به نواحی کاشت مختلف یا فصول متفاوت، می­باشد. چندین ژن مرتبط با زمان خوشه­دهی در برنج شناسایی شده است که یکی از مهمترین آنها ژن Hd1 بر روی کروموزوم شماره 6 برنج می­باشد. در این مطالعه دو رقم برنج شامل ارقام صدری (به عنوان والد بخشنده زودرس) و ندا (به عنوان والد دوره­ای دیر­رس)، به منظور بررسی اثر ناحیه ژنومی حامل ژن Hd1 بر زمان خوشه­دهی در برنج، تلاقی داده شدند و با دو بار تلاقی برگشتی نسل BC2 ایجاد گردید. سپس یک بوته هتروزیگوت از نسل BC2 خودگشن گردید تا جمعیت BC2F2 جهت انجام مطالعات فنوتیپی و مولکولی به دست آید. جمعیت مورد مطالعه از نظر زمان خوشه­دهی دارای توزیع فنوتیپی پیوسته بوده و برخی افراد جمعیت تفکیک متجاوز نسبت به والد دیررس نشان دادند. بر اساس ناحیه InDel موجود در اگزون شماره یک ژن Hd1 یک نشانگر کارکردی اختصاصی طراحی شد که تفاوت باندی واضحی بین والدین تلاقی ایجاد نمود. از اینرو، این نشانگر جهت ارزیابی الگوی آللی Hd1 در جمعیت BC2F2 استفاده گردید. بررسی نحوه تفکیک آللی نشان داد که مکان ژنی Hd1 در جمعیت مورد مطالعه از الگوی تفرق مورد انتظار مندلی (با نسبت 1:2:1) پیروی نمود. نقشه­یابی فاصله­ای مرکب (CIM) با نشانگرهای ریزماهواره نشان داد که ناحیه ژنومی در حد فاصل نشانگرهای Hd1-RM527 ارتباط زیادی (5/7نشانگر کارکردی توسعه یافته در این تحقیق می­توان برای ردیابی ژن Hd1 در جمعیت­های در حال تفرق و گزینش به کمک نشانگر (MAS) برای زودرسی استفاده کرد.

کلیدواژه ها:

زودرسی ، نشانگر کارکردی ، نقشه یابی

نویسندگان

اسداله احمدی خواه
لیلا نیری پسند

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ahmadikhah A (2009). A rapid mini-prep DNA extraction method in ...
  • Ahmadikhah A, Arkhy A, Ghafari H (2010). Development of an ...
  • Ahmadikhah A, Irannejad A (2010). Development of a co-dominant CMS-specific ...
  • Brondani C, Rangel PHN, Brondani RPV, Ferreira ME (2002). QTL ...
  • Doi K, Izawa T, Fuse T, Yamanouchi U, Kubo T, ...
  • Fan CC, Yu XQ, Xing YZ, Xu CG, Luo LJ, ...
  • Gaafar RM (2010). Molecular marker analysis of heading date Hd1 ...
  • Goff SA, Ricke D, Lan TH, Presting G, Wang RL, ...
  • Hirotsu N, Murakami N, Kashiwagi T, Ujiie K, Ishimaru K ...
  • Hayama R, Yokoi S, Tamaki S, Yano M, Shimamoto K ...
  • Hittalmani S, Shashidhar HE, Bagali PG, Huang N, Sidhu JS, ...
  • Hospital F, Chevalet C, Mulsant P (1992). Using Markers in ...
  • Hospital F (2009). Challenges for effective marker-assisted selection in plants. ...
  • Kiani Gh (2011). Marker aided selection for aroma in F2 ...
  • Kim SL, Lee S, Kim HJ, Nam HG, An G ...
  • Kinnear PR, Colin DG (2000). SPSS for Windows made simple: ...
  • Kojima S, Takahashi Y, Kobayashi Y, Monna L, Sasaki T, ...
  • Komiya R, Ikegami A, Tamaki S, Yokoi S, Shimamoto K ...
  • LaFramboise T, Weir BA, Zhao X, Beroukhim R, Li C, ...
  • Lin HX, Yamamoto T, Sasaki T, Yano M (2000). Characterization ...
  •  Lin SY, Sasaki T, Yano M (1998). Mapping quantitative trait ...
  • Liu Q, Sommer SS (2004). Detection of extremely rare alleles ...
  • Lu C, Shen L, Tan Z, Xu Y, He P, ...
  • Maheswaran M, Huang N, Sreerangasamy SR, McCouch SR (2000). Mapping ...
  • Nayyeripasand L, Babaeian Jelodar N, NematzadehGA, Ahmadikhah A, Azimi MR ...
  • Ordonez SA, Silva J, Oard JH (2010) Association mapping of ...
  • Park WD (1995). Identification of quantitative trait loci (QTLs) for ...
  • Rabiei B (2007). Linkage map of SSR markers and QTLs ...
  • Sano Y (1992). Genetic comparisons of chromosome 6 between wild ...
  • Semagn K, Bjørnstad A, Ndjiondjop MN (2006). Progress and prospects ...
  • Soleimani VD, Baum BR, Johnson DA (2003). Efficient validation of ...
  • Tsai KH (1995). Genetic analysis for heading time in wild ...
  • Tsuji H, Tamaki S, Komiya R, Shimamoto K (2008). Florigen ...
  • Wang S, Basten CJ, Zeng ZB (2005). Windows QTL Cartographer ...
  • Wang J, Chapman SC, Bonnett DG, Rebetzke GJ, Crouch J ...
  • Yamamoto T, Kuboki Y, Lin SY, Sasaki T, Yano M ...
  • Yano M, Harushima Y, Nagamura,Y, Kurata N, Minobe Y, Sasaki ...
  • Yano M, Katayose Y, Ashikari M, Yamanouchi U, Monna L, ...
  • Yokoo M, Kikuchi F, Nakane A, Fujimaki H (1980). Genetical ...
  • Yu SB, Li JX, Xu CG, Tan YF, Li XH, ...
  • Yu-long X, Chuan-yuan Y, Jian-guo L, Ma-zhong L, Lin J, ...
  • Zhou Y, Li W, Wu W, Chen Q, Mao D, ...
    • نمایش کامل مراجع