QSAR Model for Prediction of some Non-Nucleoside Inhibitors of Dengue Virus Serotype 4 NS5 using GFA-MLR Approach
محل انتشار: فصلنامه مقالات شیمی، دوره: 1، شماره: 3
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 278
فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCHE-1-3_001
تاریخ نمایه سازی: 22 دی 1399
چکیده مقاله:
B3LYP/631G** basis set of DFT quantum mechanical method was used to optimize the molecular geometry of some non-nucleoside inhibitors of dengue 4 virus. Molecular descriptors were mined from the optimized structure and used along with their experimental inhibitory activity (pIC50) as the database for the study. Genetic function algorithm and multiple linear regressions were used to build a robust quantitative structure-activity relationship model. The statistically satisfactory quality of the model as evidenced by its validation parameters: R2 = 0.971, R2adj = 0.961, cRp^2 = 0.809 Q2 = 0.944 and R2pred = 0.627. Thus, the model can be used to predict the activity of new chemicals within its applicability domain. The Average Broto-Moreau autocorrelation - lag 1 / weighted by mass, Centered Broto-Moreau autocorrelation - lag 2 / weighted by Sanderson electronegativities, Coefficient sum of the last eigenvector from Barysz matrix / weighted by van der Waals volumes, nhigh lowest polarizability weighted BCUTS and Fraction of sp3 carbons to sp2 carbons are the descriptors that influenced the anti-dengue activity of the studied compounds. The information obtained from the model in this work can be employed to optimize the anti-dengue activity of the compounds.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
Samuel Adawara
Department of Pure and Applied Chemistry, Faculty of Science, University of Maiduguri, P.M.B. ۱۰۶۹, Maiduguri, Borno State, Nigeria.
Gideon Shallangwa
Department of Chemistry, Faculty of Physical Sciences, Ahmadu Bello University, P.M.B. ۱۰۴۴, Zaria, Kaduna State, Nigeria.
Paul Mamza
Department of Chemistry, Faculty of Physical Sciences, Ahmadu Bello University, P.M.B. ۱۰۴۴, Zaria, Kaduna State, Nigeria.
Abdulkadir Ibrahim
Department of Chemistry, Faculty of Physical Sciences, Ahmadu Bello University, P.M.B. ۱۰۴۴, Zaria, Kaduna State, Nigeria.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :