آنالیز ترانسکریپتوم گیاه دارویی هندوانه ابوجهل (Citrullus colocynthis L.) به منظور شناسایی ژن های مسیر بیوسنتزی دیترپنوئید

در این مطالعه ما برای اولین بار یک گزارش عمومی از ژنهایی که برای بیوسنتز دیترپنوئیدها در هندوانه ابوجهل دخیل هستند، ارائه کردیم. داده های توالی یابی RNA با اطلاعات بیوشیمیایی مرتبط بوده که پایهای برای تحقیقات کاربردی ژنومی و ترانسکریپتومی برای شناسایی بیوسنتز متابولیت های ثانویه در گیاهان دارویی است. در اینجا ژن های کاندید برای مسیرهای بیوسنتزی جیبرلین گزارش شده است. برای شناسایی آنزیم ها و رونوشت های درگیر در بیوسنتز جیبرلین ها، پروفایل ترانسکریپتوم از میوه سبز هندوانه ابوجهل را با استفاده از بن سازه Iluumina HiSeq2500 اجرا کرده که بعد از کنترل کیفیت تعداد 885،952،21 خوانش دارای کیفیت بالا تولید شد. تخصیص تکمیلی از 311،55 تکژن یکپارچه سازی شده توسط برنامه ی Evidential-gene وتفسیر مسیرهای بیوشیمیایی KEEG که 657،13 تکژن را نشان میدهند به 134 مسیر زیستی اشاره دارند. از جمله آنزیم های کدگذاری شده در مراحل اولیه مسیر بیوسنتز جیبرلین ها، مانند کوپالیل دیفسفات سینتاز (CPS)، کائورن سینتاز (KSL)، انت-کائورن اکسیداز (CYP701) شناسایی شدند.