ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

طراحی بیوانفورماتیکی و ساخت کاست ژنی دربردارنده‌ی ژن‌های blf1، ctxB و stxB

محل انتشار: مجله دانشکده علوم پزشکی نیشابور، دوره: 8، شماره: 4
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 288

فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1157514

شناسه ملی سند علمی:

JR_NUMS-8-4_007

تاریخ نمایه سازی: 3 اسفند 1399

چکیده مقاله:

مقدمه باکتری بورخولدریا سودومالئی، ویبریوکلرا و شیگلا دیسانتری عامل بیماری میلوئیدوزیس، وبا و شیگلوز در انسان می­باشند. پروتئین­های BLF1 مربوط به B. pseudomallei، ­CTxB ویبریوکلرا و StxB شیگلا دیسانتری خاصیت آنتی­ژنیک، ادجوانتی مخاطی، حاملی و ایمنی‌زایی دارند. هدف این مطالعه، ساخت کاست ژنی دربردارنده­ی ژن­های blf1، ctxB وstxB  و بیان­ پروتئین آن­ها در E. coli می­­­باشد. مواد و روش­ها با استفاده از نرم­افزار­های بیوانفورماتیک Protparam و Modeller، حالت­های مختلف پروتئین کایمریک ژن­های مربوطه بررسی شد. ساختار دوم پروتئین و اپی­توپ­های خطی و ساختاری نیز تعیین گردید. ژن‌های blf1 و stxB از پلاسمید pET28a-BLF1-STxB، PCR و قطعه 850 جفت بازی BLF1-STxB با جایگاه­های آنزیمی NotI وSalI  در وکتور بیانی pET28a-CTxB زیرهمسانه­سازی و به باکتری E. coli سویه­ی BL21(DE3) ترانسفورم شد. پس از توالی‌یابی، بهینه‌سازی بیان ژن سنتزی تحت القایIPTG (Isopropyl-β-D-thiogalactoside)  و درجه حرارت 25 درجه سانتیگراد انجام و بوسیله تکنیک SDS-PAGE مورد ارزیابی قرار گرفت. یافته­ها شاخص ناپایداری پروتئین کایمر برابر با 06/40 و نیمه­عمر آن در E. coli بیش از 10 ساعت به دست آمد. شاخص سازگاری کدون سازه­ی کایمر به 9/0 و محتوای GC آن به 9/54 درصد افزایش یافت. بهترین ترتیب ممکن برای ساخت واکسن نوترکیب، ممزوج سه­تایی CTxB-BLF1-STxB بدست آمد. بیان پروتئین نوترکیب از ژن سنتزی تحت القای IPTG، منجر به تولید پروتئینی با وزن مولکولی 48 کیلودالتون شد. نتیجه­گیری با توجه به توانایی توقف پروتئین­سازی BLF1، خاصیت حاملی STxB و خاصیت ادجوانتی CTxB، قرار دادن این سه ژن در یک کاست ژنی به بهترین حالت، می­تواند به عنوان یک کاندید واکسن مناسب مورد توجه قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

زهرا مشیری

Imam Khomeini International University

رحیم حداد

Imam Khomeini International University

حسین هنری

۳: Biological Research Center, Imam Hossein Comprehensive University. Tehran, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • 1. Titball RW, Burtnick MN, Bancroft GJ, Brett P. Burkholderia pseudomallei ...
  • 2. Wiersinga WJ, Currie BJ, Peacock SJ. Melioidosis. “N. Engl. J. ...
  • 3. Chu J, Pelletier J. Targeting the eIF4A RNA helicase as ...
  • 4. Cruz-Migoni A, Hautbergue GM, Artymiuk PJ, Baker PJ, Bokori-Brown M, ...
  • 5. Malina A, Cencic R, Pelletier J. Targeting translation dependence in ...
  • 6. Masoudi Kerahroudi M, Honari H, E'temad aubi Sm, Abdollahi M. ...
  • 7. Masoudi Kerahroudi M, Honari H, abdollahi m. Expression of Blf1-Stx ...
  • 8. Masoudi Kerahroudi M, Honari H, Minaei ME, Abdollahi M. Expression ...
  • 9. Puzari M, Sharma M, Chetia P. Emergence of antibiotic resistant ...
  • 10. Honari H, Amlashi I, Minaei M, Safaei S. Immunogenicity in ...
  • 11. Engedal N, Skotland T, Torgersen ML, Sandvig K. Shiga toxin ...
  • 12. Lunelli M, Lokareddy RK, Zychlinsky A, Kolbe M. IpaB–IpgC interaction ...
  • 13. Oladokun MO, Okoh IA. Vibrio cholerae: A historical perspective and ...
  • 14. Odumosu O, Nicholas D, Yano H, Langridge W. AB toxins: ...
  • 15. Shen My, Sali A. Statistical potential for assessment and prediction ...
  • 16. Nazarian S. An in silico chimeric multi subunit vaccine targeting ...
  • 17. Puigbo P, Guzman E, Romeu A, Garcia-Vallve S. OPTIMIZER: a ...
  • 18. Garg VK, Avashthi H, Tiwari A, Jain PA, Ramkete PW, ...
  • 19. Amerian M, Nazarian S, Honari H, Minaie ME, KORDBACHEH E. ...
  • 20. Barrick JE, Roberts RW. Sequence analysis of an artificial family ...
  • 21. Banerjee R, Das B, Nair GB, Basak S. Dynamics in ...
  • 22. Baldauf K, Royal J, Hamorsky K, Matoba N. Cholera toxin ...
  • 23. Jafari D, DEHGHAN NF, Honari H, Hoseini R, Jafari R. ...
  • 24. Eramian D, Shen My, Devos D, Melo F, Sali A, ...
  • 25. Madanchi H, Honari H, Sadraeian M, Hesaraki M. Fusion of ...
  • 26. Kundu J, Mazumder R, Srivastava R, Srivastava BS. Intranasal immunization ...
  • 27. Patwary NIA, Islam MS, Sohel M, Ara I, Sikder MOF, ...
  • 28. Faruque SM, Albert MJ, Mekalanos JJ. Epidemiology, Genetics, and Ecology ...
  • 29. Honari H, Minaei H, Ebrahim M. Analyzing the Various Fusions ...
  • 30. Dertzbaugh M, Elson C. Reduction in oral immunogenicity of cholera ...
    • نمایش کامل مراجع