عناصر تنظیمی بالادست، ژنهای هدف بالقوه و الگوی بیان سه miRNA پاسخدهنده به تنش خشکی در دو رقم انگور
محل انتشار: مجله پژوهش های ژنتیک گیاهی، دوره: 6، شماره: 1
سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 352
فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_PGRLU-6-1_008
تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1399
چکیده مقاله:
میکروRNAها (miRNAs) بهعنوان گروهی از RNAهای کوچک غیرکدکننده نقش مهمی در تنظیم رشد، نمو و پاسخ گیاهان به تنشهای مختلف ایفا میکنند. در این تحقیق بیان سه miRNA پاسخدهنده به خشکی (miR160 ، miR159 و (miR169 با استفاده ازqRT-PCR در دو رقم انگور متحمل (یاقوتی) و حساس به خشکی (بیدانهسفید) تحت شرایط تنش خشکی مورد مقایسه قرار گرفت. بهمنظور شناسایی عناصر تنظیمی بالقوه در پروموتر miRNAهای مورد بررسی، توالی بالادست پیش ساز این miRNAها توسط پایگاه دادهای PlantCARE مورد آنالیز قرار گرفت. موتیفهای مرتبط با خشکی مانند ABREها و MBSها در مناطق تنظیمی miRNAها شناسایی شدند. سه فاکتور رونویسی مرتبط با سیگنالینگ هورمونهای گیاهی اسید آبسیزیک (ABA) و اکسین بهعنوان مهمترین ژنهای هدفmiRNA های مورد بررسی، شناسایی شدند. الگوی بیان miRNAهای مورد بررسی بسته به نوعmiRNA و نوع رقم، متفاوت بود، بهطوریکه بیان miRNA159 تحت تأثیر تنش در رقم بیدانهسفید بدون تغییر بود و در رقم یاقوتی افزایش یافت اما بیان miRNA160 وmiRNA169 در دو رقم مورد بررسی بهصورت معکوس تغییر یافت. پروفایل بیان وابسته به ژنوتیپ (رقم) نشان داد که پاسخ miRNA ها به تنش خشکی در میان ژنوتیپهای خیلی نزدیک با حساسیت متفاوت به تنش نیز متفاوت است. بهطورکلی با توجه به نقش ژنهای هدف بالقوه miRNA های مورد بررسی، بهنظر میرسد که تغییر بیان miRNAهای ارزیابیشده درنهایت به تحمل بهتر تنش خشکی در رقم یاقوتی منجر میشود.
کلیدواژه ها:
Bidanesefid ، Drought ، Target gene ، Regulatory elements ، Yaghuti ، بیدانهسفید ، خشکی ، ژن هدف ، عناصر تنظیمی ، یاقوتی
نویسندگان
اعظم مویدی نژاد
Grape and Raisin Research Institute, Malayer University, Malayer, Iran
بهروز محمد پرست
Grape and Raisin Research Institute, Malayer University, Malayer, Iran
قاسم حسینی سالکده
Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran
احسان محسنی فرد
Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, University of Zanjan, Zanjan, Iran
محمد علی نجاتیان
Horticulture Crops Research Department, Qazvin Agricultural and Natural Resources Research and Education Center, AREEO, Qazvin, Iran