تنوع آنالوگ‌های ژن‌های مقاومت به بیماری در ارقام مقاوم و حساس به زنگ گندم نان

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 304

فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_PGRLU-5-2_003

تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1399

چکیده مقاله:

بیماری‌های قارچی به خصوص زنگ‌های زرد و قهوه‌ای باعث کاهش عملکرد گندم در ایران و جهان می‌شوند. در این مطالعه، تنوع ژنتیکی 20 رقم گندم نان با پاسخ متفاوت به زنگ‌های قهوه‌ای و زرد با استفاده از آغازگرهای طراحی شده براساس نواحی حفاظت شده ژن‌های مقاومت به بیماری بررسی شد. الگوی نواری نشانگرهای چند شکل به صورت غالب امتیازدهی و تعداد نوار تکثیر شده و درصد چند شکلی تعیین گردید. علاوه بر این، برای هر ترکیب آغازگری، پارامترهای محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC) و شاخص نشانگر (MI) محاسبه شد. از مجموع 11 ﺁغازگر منفرد و جفت، پنج ترکیب ﺁغازگری به همراه یک آغازگر منفرد تکثیر مناسب و قابل امتیازدهی تولید کردند. حداکثر و حداقل میانگین PIC به ترتیب مربوط به آغازگر LLOOP-1 و جفت آغازگر H2016-H2020 با میزان 0.50 و 0.28 بود. جفت آغازگرهای H2016-H1146 و H2016-H2020 با میانگین 4.80 و 2.84 به ترتیب حداکثر و حداقل MI را داشتند. تجزیه خوشه‌ای براساس الگوریتم Neighbor-Joining و ضریب فاصله تکاملی P-distance، ارقام مورد مطالعه را به چهار گروه منتسب کرد و این گروه‌بندی با پاسخ به زنگ زرد ارقام مطابقت داشت. در تجزیه به بردارهای اصلی، پراکنش ارقام براساس دو بردار اصلی اول، چهار گروه حاصل از تجزیه خوشه‌ای را تأیید کرد.

نویسندگان

فرانک خان ماکو

Department of Plant Breeding and Biotechnology‚ Faculty of Agriculture, Tabriz University

سید ابوالقاسم محمدی

Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Tabriz University, Tabriz, Iran

رباب سلامی

Department of Plant Breeding and Biotechnology‚ Faculty of Agriculture, Tabriz University

سعید اهری زاد

Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Tabriz University

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ameline-Torregrosa, C., Wang, B.B., O'Bleness, M.S., Deshpande, S., Zhu, H., ...
  • Arya, P., Kumar, G., Acharya, V. and Singh, A.K. (2014). ...
  • Bouktila, D., Khalfallah, Y., Habachi-Houimli, Y., Mezghani-Khemakhem, M., Makni, M. ...
  • Chen, X.M. (2005). Epidemiology and control of stripe rust (Puccinia ...
  • Chen, J.Y., Huang, J.Q., Li, N.Y., Ma, X.F., Wang, J.L., ...
  • Chen, X.M., Line, R.F. and Leung, H. (1998). Genome scanning ...
  • Cheng, X., Jiang, H., Zhao, Y., Qian, Y., Zhu, S. ...
  • Cheng, Y., Li, X., Jiang, H., Ma, W., Miao, W., ...
  • Cheng, J.P., Yan, J. and Dahan, A. (2003). Disease resistance ...
  • Cloutier, S., Mccallum, B.D., Loutre, C., Banks, T.W., Wicker, T., ...
  • FAO. (2017). FAO STAT. www.faostat.Fao.org. ...
  • Fritz-Laylin, L.K., Krishnamurthy, N., Tor, M., Sjolander, K.V. and Jones, ...
  • Gill, B.S., Appels, R., Botha-Oberholster, A.M., Buell, C.R., Bennetzen, J.L., ...
  • Gu, L., Si, W., Zhao, L., Yang, S. and Zhang, ...
  • Habibzadeh, E., Keshavarzi, M., Afshari, F. and Naghavi, M.R. (2007). ...
  • Jia, J., Zhao, S., Kong, X., Zhao, G., He, W., ...
  • Jiang, H., Wang, C., Ping, L., Tian, D. and Yang, ...
  • Karakas, O., Gurel, F. and Uncuoglu, A.A. (2011). Assessment of ...
  • Kassa, M.T., You, F.M., Hiebert, C.W., Pozniak, C.J., Fobert, P.R., ...
  • Leister, D., Ballvora, A., Salamini, F., and Gebhardt, C. (1996). ...
  • Ling, H.-Q., Zhao, S., Liu, D., Wang, J., Sun, H., ...
  • Liu, J., Liu, X., Dai, L. and Wang, G. (2007). ...
  • Ma, J. (2015). Coordination of microRNAs, phasiRNAs, and NB-LRR genes ...
  • Maestra, B. and Naranjo, T. (2000). Genome evolution in Triticeae. ...
  • Mantovani, P., Van der Linden, G., Maccaferri, M., Sanguintei, M.C. ...
  • Mace, E., Tai, S., Innes, D., Godwin, I., Hu, W., ...
  • McIntosh, R.A., Welling, C.R. and Park, R.F. (1995). Wheat rusts: ...
  • O'Toole, N., Hattori, M., Andres, C., Iida, K., Lurin, C., ...
  • Powell, W., Morgante, M., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., ...
  • Reynolds, M., Moya, E.S., Molero, G., Vargas, M. and Payne, ...
  • Richly, E., Kurth, J. and Leister, D. (2002). Mode of ...
  • Roldain-Ruiz, I., Calsyn, E., Gilliand, T.J., Coll, R., van Eijk, ...
  • Rommens, C.M. and Kishore, G.M. (2000). Exploiting the full potential ...
  • Saghai-Maroof, M.A., Soliman, K., Jorgensen, R.A. and Allard, R.W. (1984). ...
  • Sekhwal, M. K., Li, P., Lam, I., Wang, X., Cloutier, ...
  • Shewry, P.R. (2009). Wheat. Journal of Experimental Botany, 6: 1537-1553. ...
  • Singh, S., Chand, S., Singh, N.K. and Sharma, T.R. (2015). ...
  • Soriano, J. M., Vilanova, S., Llacer, C.R.G. and Badenes, M.L. ...
  • Tabassum, S., Ashraf, M. and Chen, X. (2010). Evaluation of ...
  • Tamura, K., Dudley, J., Nei, M. and Kumar, S. (2011). ...
  • Wang, M., van den Berg, R., Van der Linden, G. ...
  • Wang, S.S., Wang, F., Tan, S.J., Wang, M.X., Sui, N. ...
  • Wei, H., Li, W., Sun, X., Zhu, S. and Zhu, ...
  • Wise, R.P. (2000). Disease resistance: what's brewing in barley genomics? ...
  • نمایش کامل مراجع