مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم با صفات تولید شیر و معیار سلولهای بدنی گاوهای هلشتاین ایران

در پرورش گاوشیری هدف اصلی افزایش سود است. افزایش بیماری ورمپستان از مشکلات اصلی پرورش گاوشیری با کاهش طولعمر تولیدی و افزایش هزینهها، سبب تحمیل زیانهای اقتصادی جدی به این صنعت شدهاست. این مطالعه باهدف بررسی معماری ژنتیکی و شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با صفات تولیدشیر و تعداد سلولهای بدنی بهعنوان یکی از شاخصهای ارزیابی کیفیت شیر و معیاری غیرمستقیم از بیماری ورمپستان، انجام شدهاست. برای بررسی ارتباط و شناسایی پنجرههای ژنومی اصلی، از روش مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم یکمرحلهای با دادههای ژنومی ۱۹۳۸ راس گاو نر استفاده شد. نتایج براساس واریانس ژنتیکی افزایشی پنجرههای ۵/۱ مگابازی از SNPهای مجاور ارائه شده است. پنجرههایی که بیش از ۱% واریانس را کنترل میکنند بهعنوان نواحی ژنومی اصلی و جهت یافتن ژنهای کاندیدا استفاده شدند. تعداد ۱۱ پنجره ژنومی اصلی روی ۹ کروموزوم اتوزوم، حاوی ۹۴ ژن کاندیدا حدود ۲۰% واریانس ژنتیکی معیار سلولهای بدنی را توصیف میکردند. بیشترین واریانس مربوط به پنجرهای روی کروموزوم ۱۴ (۸۵/۳%) بود. تعداد ۶ پنجره اصلی روی ۶ کروموزوم شامل ۸۹ ژن کاندیدا، مرتبط با تولیدشیر بودند. این پنجرهها ۸/۸% واریانس و مهمترین پنجره روی کروموزوم ۱۰، حدود ۰۸/۲% واریانس را کنترل مینمودند. درخصوص مقدار چربی و پروتئین شیر، بهترتیب تعداد ۹ منطقه روی ۷ کروموزوم، حدود ۶/۱۵% و ۹ پنجره روی ۸ کروموزوم، حدود ۶/۱۰% از  واریانس را توصیف میکردند. نتایج نشان داد که ۴ ناحیه ژنومی اثر پلیوتروپی دارند. یافتههای این تحقیق میتواند بهعنوان منبع اطلاعاتی مهمی در ارزیابیهای ژنومی صفات تولید شیر و تعداد سلولهای بدنی باشد.