اثر متقابل ژنوتیپ و محیط بر صحت ارزیابی ژنومی صفات تولید شیر گاوهای هلشتاین در ایران

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 419

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JAP-22-4_002

تاریخ نمایه سازی: 14 اردیبهشت 1400

چکیده مقاله:

به منظور بررسی صحت ارزیابی ژنومی صفات تولید شیر گاوهای هلشتاین ایران در حضور اثر متقابل ژنوتیپ و محیط، از تعداد ۳۴۴۱۷۰، ۱۳۵۰۰۰و ۱۵۶۸۴۰ رکورد روزانه بهترتیب برای مقدار شیر، چربی و پروتئین در دوره شیردهی اول از ۳۴۴۱۷، ۱۳۵۰۰ و ۱۵۶۸۴ راس گاو ماده و ۱۹۳۵ پدر ژنوتیپ شده بر اساس نشانگرهای SNP استفاده شد. این دادهها طی سالهای ۱۳۹۲ لغایت ۱۳۹۷ از بانک اطلاعات مرکز اصلاح نژاد دام و بهبود تولیدات دامی کشور استخراج گردید. جهت در نظر گرفتن اثر متقابل ژنوتیپ و محیط از متوسط شاخص دما-رطوبت نسبی (THI) طی سه روز قبل از روز رکوردگیری، بهعنوان عوامل محیطی با خصوصیت پیوسته، مربوط به ۳۵ ایستگاه هواشناسی در مجاورت ۱۳۹ گله گاو هلشتاین با رکورد روز آزمون از ۱۳ استان استفاده شد. مولفه های (کو)واریانس از طریق مدل تابعیت تصادفی یک صفته با استفاده از نرم افزار AIREMLF۹۰ و در تابع لژاندر مرتبه دو برای روزهای شیردهی و THI، برآورد گردید. نتایج نشان داد تغییر THI طی دوره شیردهی، منجر به تغییر مقدار واریانس ژنتیکی افزایشی میشود. تغییرات وراثتپذیری صفات تولید شیر در طول دوره شیردهی نیز مشابه واریانس ژنتیکی افزایشی بود. آنالیز اعتبار سنجی برای مقایسه صحت پیش بینی شده در مدلهایی با و بدون THI منجر به افزایش صحت با قراردادن اطلاعات ژنومی و بهبود نااریبی با وجود THI در مدل میشود. با توجه به تغییر عملکرد دختران گاوهای نر طی روزهای شیردهی و با مقادیر مختلف THI، برای انتخاب گاونر در شرایط مختلف باید اثر متقابل ژنوتیپ و محیط در نظر گرفته شود.

نویسندگان

بهروز محمدنظری

دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج. ایران

اردشیر نجاتی جوارمی

استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج. ایران

محمد مرادی شهربابک

استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج. ایران

رستم عبدالهی آرپناهی

پژوهشگر، گروه علوم دامی، دانشگاه فلوریدا، گینزویل، آمریکا.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • 1. Bernabucci U, Biffani S, Buggiotti L, Vitali A,Laceter اa ...
  • Journal of Dairy Science, 97(1): 471-486 ...
  • 2. Bohlouli M, Alijani S, Naderi S, Yin T, andKönig ...
  • 3. Forneris NS, Steibel J, Legarra A, Vitezica Z,Bates R, ...
  • 4. Hammami H, Rekik B and Gengler N (2009)Genotype by ...
  • 5. Hayes BJ, Bowman PJ, Chamberlain AJ, SavinK, Van Tassell ...
  • 6. Hijmans RJ, Williams E, Vennes C and HijmanMRJ (2016) ...
  • 19, 2017. https: / / cran .r-project .org/ web/packages/ geosphere/ ...
  • 7. Kelly CF and Bond TE (1971) BioclimaticFactors and Their ...
  • 8. Lillehammer M, Árnyasi M, Lien S, Olsen HG,Sehested E, ...
  • 9. Meuwissen THE, Hayes B and Goddard ME(2001) Prediction of ...
  • 10. Misztal I, Tsuruta S, Strabel T, Auvray B,Druet T ...
  • In: Proceedings of the 7th World Congress forthe Genetic Applied ...
  • 11. Misztal I, Legarra A and Aguilar I (2014)Using recursion ...
  • 12. Nejati-Javaremi A, Smith C and Gibson JP(1997) Effect of ...
  • 13. Nishiura A, Sasaki O, Aihara M, Takeda H andSatoh ...
  • Journal of Animal Science, 86: 961-969 ...
  • 14. Oliveira HR, Brito LF, Silva FF, LourencoDAL, Jamrozik J ...
  • 15. Pérez-Cabal MA, Vazquez AI, Gianola D,Rosa GJM and Weigel ...
  • 16. Purcell S, Neale B, Todd-Brown K, Thomas L,Ferreira MAR, ...
  • 17. Santana M, Bignardi A, Pereira R, Stefani Gand Faro ...
  • 19. Sánchez JP, Misztal I, Aguilar I, Zumbach Band Rekaya ...
  • 20. Sargolzaei M, Chesnais JP and Schenkel FS(2011) FImpute-An efficient ...
  • 21. Tiezzi F, de los Campos G, Parker Gaddis Kand ...
  • 22. VanRaden PM and Sullivan PG (2010)International genomic evaluation methods ...
  • 24. Yao C, De Los Campos G, VandeHaar M,Spurlock D, ...
  • 25. Yin T and Konig S (2016) Genomics forphenotype prediction ...
  • نمایش کامل مراجع