ارزیابی تنوع ژنتیکی زعفران (Crocus sativus L.) با استفاده از نشانگرهای مولکولی iPBS و SSR

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 288

فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JSRB-4-1_008

تاریخ نمایه سازی: 22 اردیبهشت 1400

چکیده مقاله:

به منظور مطالعه تنوع ژنتیکی زعفران، شش اکوتیپ زراعی از نقاط مختلف استان خراسان رضوی (مشهد، تربت­جام، گناباد و تربت­حیدریه) و استان خراسان جنوبی (قاین و بیرجند) تهیه و با استفاده از نشانگرهای مولکولی iPBS و SSR مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج تجزیه­های مولکولی نشان داد که ۲۸ نشانگر iPBS و ۲۲ نشانگر SSR به ترتیب ۱۷۹ و ۴۴ آلل چندشکلی را شناسایی نمودند و تعداد باندهای تکثیر یافته برای هر نشانگر به ترتیب ۱۰-۳ (میانگین ۴/۶) و ۳-۱ (میانگین ۲) بود. همچنین میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی نشانگرهای iPBS و SSR به ترتیب ۷۹/۰ و ۴۰/۰ تخمین زده شد. از طرفی، نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که بر اساس نشانگر iPBS واریانس درون اکوتیپها نسبت به واریانس بین اکوتیپها بیشتر میباشد، در حالی­که بر اساس نشانگر SSR واریانس بین اکوتیپها بیشتر از واریانس داخل اکوتیپها بود. همچنین تجزیه خوشه، اکوتیپ­های مورد مطالعه را در سه گروه قرار داد و این گروه­بندی توسط تجزیه به مولفه­های اصلی مورد تایید قرار گرفت. با این­حال، اکوتیپ­های بیرجند و گناباد و همچنین اکوتیپ­های تربت­حیدریه و قاین از لحاظ هر دو تجزیه خوشه­ای اختلاف معنی­داری با یکدیگر نداشتند. با این­حال، شباهت ژنتیکی بالایی بین کلیه اکوتیپهای زعفران گزارش شد. نتایج این تحقیق نشان داد اگر چه هر دو نشانگر در ارزیابی تنوع ژنتیکی اکوتیپ­های زعفران کارآمد بودند، ولی نشانگر iPBS در مقایسه با نشانگر SSR کارایی بالاتری در تعیین تنوع ژنتیکی اکوتیپ­های مورد مطالعه زعفران داشت. 

کلیدواژه ها:

نویسندگان

مهدی بیات

دانش آموخته دکتری زراعت، گرایش اکولوژی گیاهان زراعی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه

رضا امیرنیا

دانشیار دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه

مهدی تاجبخش

۳- استاد دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه

بهاتین تانیولاچ

استاد دانشکده بیومهندسی، دانشگاه اگه، ازمیر، ترکیه.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Aalami, A., Safiyar, S., Abdollahi Mandoulakani, B., ۲۰۱۲. R-RAP: a ...
  • Abdullaev, F., ۲۰۰۶. Biological properties and medicinal use of saffron ...
  • Abdullaev, F.I., ۲۰۰۲. Cancer chemopreventive and tumoricidal properties of saffron ...
  • Abolhasani, A., Bathaie, S.Z., Yavari, I., Moosavi-Movahedi, A.A., Ghaffari, M., ...
  • Agayev, Y.M.O., Fernandez, J.A., Zarifi, E., ۲۰۰۹. Clonal selection of ...
  • Ahmadi, A., Nazari Alam, J., ۲۰۱۵. Effects of biological and ...
  • Alipoor Miandehi, Z., Mahmoodi, S., Behdani, M.A., Sayyari, M.H., ۲۰۱۵. ...
  • Babaei, S., Talebi, M., Bahar, M., Zeinali, H., ۲۰۱۴. Analysis ...
  • Baraket, G., Chatti, K., Saddoud, O., Abdelkarim, A.B., Mars, M., ...
  • Beiki, A.H., Keify, F., Mozafari, J., ۲۰۱۱. Rapid genomic DNA ...
  • Beiki, A.H., Keifi, F., Mozafari, J., ۲۰۱۰. Genetic differentiation of ...
  • Budak, H., Shearman, R.C., Parmaksiz, I., Gaussoin, R.E., Riordan, T.P., ...
  • Castro, I., Martin, J.P., Ortiz, J.M., Pinto-Carnide, O., ۲۰۱۱. Varietal ...
  • Erol, O., Kaya, H.B., Şik, L., Tuna, M., Can, L., ...
  • Fernandez, J.A., ۲۰۰۷. Genetic resources of saffron and allies (Crocus ...
  • Fernandez, S.C., Bendersky, G., ۲۰۰۴. Therapy with saffron and the ...
  • Grilli Caiola, M., Caputo, P., Zanier, R., ۲۰۰۴. RAPD analysis ...
  • Gur-arie, R., Cohen, C.J., Eitan, Y., Shelef, L., Hallerman, E.M., ...
  • He, Q., Li, X.W., Liang, G.L., Ji, K., Guo, Q.G., ...
  • Johnson, P.G., Kenworthy, K.E., Auld, D.L., Riordan, T.P., ۲۰۰۱. Distribution ...
  • Kalendar, R., Antonius, K., Sm´ykal, P., Schulman, A.H., ۲۰۱۰. iPBS: ...
  • Keify, F., Beiki, A.H., ۲۰۱۲. Exploitation of random amplified polymorphic ...
  • Keneni, G., Bekele, E., Imtiaz, M., Dagne, K., Getu, E., ...
  • Khlestkina, E.K., Pestsova, E.G., Salina, E., Roder, M.S., Arbuzova, V.S., ...
  • King, T.L., Burek, T., ۱۹۹۹. Special issue on gene conservation: ...
  • Koocheki, A., Seyyedi, S.M., ۲۰۱۵. Phonological stages and formation of ...
  • Liu, K., Muse, S.V., ۲۰۰۵. Power Marker: An integrated analysis ...
  • Lou, Q., Chen, J., ۲۰۰۷. Ty۱-copia retrotransposon-based SSAP marker development ...
  • Messmer, M.M., Melchinger, A.A., Boppenmair, J., Brunklaus-Jung, E., Hermann, R.G., ...
  • Mohammadi, S.A., Khodarahmi, M., Jamalirad, S., Jalal Kamali, M.R., ۲۰۰۹ ...
  • Namayandeh, A., Nemati, Z., Kamelmanesh, M.M., Mokhtari, M., Mardi, M., ...
  • Negbi, M., ۱۹۹۹. Saffron cultivation: past, present and future prospect. ...
  • Nekouei, N., Behdani, M.A., Khashei-Siuki, A., ۲۰۱۴. Predicting saffron yield ...
  • Queen, R.A., Gribbon, B.M., James, C., Jack, P., Falvell, A.J., ...
  • Roldan- Rozi, I., Van- Eeuwijk, F.A., Gilliland, T.J., ۲۰۰۱. A ...
  • Rubio-Moraga, A., Castillo-López, R., Gómez-Gómez, L., Ahrazem, O., ۲۰۰۹. Saffron ...
  • Soufizadeh, S., Zand, E., Baghestani, M.A., Kashani, F.B., Nezamabadi, N., ...
  • Thiel, T., Michalek, W., Varshney, R.K., Graner, A., ۲۰۰۳. Exploiting ...
  • Xie, W., Zhang, X., Cai, H., Liu, W., Peng, Y., ...
  • Yeh, F.C., Yang, R.C., ۱۹۹۹. POPGENE Version ۱.۳۱. University of ...
  • Zand, A., Riahi, H., Shariatmadari, Z., Zangeneh, S., ۲۰۱۵. Effect ...
  • نمایش کامل مراجع