اطلاعات جمعیتی مارکرهای D۶S۲۸۷۹ و D۶S۲۸۰۶ واقع در ناحیه HLA-DRB۱ در جمعیت ایرانی: شناسایی اثرهایی از انتخاب طبیعی و جهت دار

سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 200

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_TBJ-3-8_006

تاریخ نمایه سازی: 23 اردیبهشت 1400

چکیده مقاله:

در این مطالعه، تنوع ژنتیکی و آزمون neutrality برای جایگاه های ژنی ریزماهواره MHC، D۶S۲۸۷۹ و D۶S۲۸۰۶ واقع در ناحیه ژنی HLA-DRB۱، بررسی شدند. اطلاعات تعیین ژنوتیپ ۷۳ فرد غیر خویشاوند برای شاخص شانون، تعداد آلل موثر مارکرها و آزمون neutrality با استفاده از برنامه های PyPop و Popgene۳۲ بررسی شدند. شاخص شانون برای مارکرهای D۶S۲۸۷۹ و D۶S۲۸۰۶ در جمعیت مطالعه شده به ترتیب ۰۳۷۲/۱ و ۸۶۰۱/۰ بود. ارزش Fnd محاسبه شده برای مارکرهای D۶S۲۸۷۹ و D۶S۲۸۰۶ نیز به ترتیب ۸۴۴۹/۰- و ۹۹۰۴/۰ تخمین زده شدند. نتایج به دست آمده از آزمون Ewens-Watterson بیانگر آن است که مارکرهای D۶S۲۸۷۹ و D۶S۲۸۰۶ در جمعیت های ایرانی به ترتیب تحت انتخاب طبیعی و جهت دار هستند. این اطلاعات پیشنهاد کننده حضور یک فشار انتخابی بر روی ناحیه ژنی HLA-DRB۱ در جمعیت های ایرانی است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

منصوره تجدد

گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران

صادق ولیان بروجنی

گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران

زهرا فاضلی عطار

گروه ژنتیک، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • References:Amirzargar, A. A., Tabasi, A., Khosravi, F., Kheradvar, A., Rezaei, ...
  • Amirzargar, A. A., Yalda, A., Hajabolbaghi, M., Khosravi, F., Jabbari, ...
  • Ammer, H., Schwaiger, F. W., Kammerbauer, C., Gomolka, M., Arriens, ...
  • Andrés, A. M., Hubisz, M. J., Indap, A., Torgerson, D. ...
  • Apanius, V., Penn, D., Slev, P. R., Ruff, L. R. ...
  • Barnetche, T., Constantin, A., Cantagrel, A., Cambon-Thomsen, A. and Gourraud, ...
  • Bernatchez, L. and Landry, C. (۲۰۰۳) MHC studies in nonmodel ...
  • Brown, J. J., Ollier, W. E. R., Thomson, W. and ...
  • Carlson, C. S., Thomas, D. J., Eberle, M. A., Swanson, ...
  • Carrington, M., Nelson, G. W., Martin, M. P., Kissner, T., ...
  • Cavestro, G. M., Frulloni, L., Neri, T. M., Seghini, P., ...
  • Cornuet, J. M. and Luikart, G. (۱۹۹۶) Description and power ...
  • de Groot, N. G., Otting, N., Doxiadis, G. G. M., ...
  • Ellegren, H. (۲۰۰۰) Microsatellite mutations in the germline: implications for ...
  • Ellegren, H., Davies, C. J. and Andersson, L. (۱۹۹۳) Strong ...
  • Ewens, W. J. (۱۹۷۲) The sampling theory of selectively neutral ...
  • Fazeli, Z. and Vallian, S. (۲۰۰۹) Estimation haplotype frequency of ...
  • Fazeli, Z. and Vallian, S. (۲۰۱۰) Evidences for balancing selection ...
  • Gaudieri, S., Dawkins, R. L., Habara, K., Kulski, J. K. ...
  • Ghabaee, M., Bayati, A., Amri Saroukolaei, S., Sahraian, M. A., ...
  • Gourraud, P. A., Hoffman, D., Cambon-Thomsen, A. and Feolo, M. ...
  • Hedrick, P. W. (۱۹۹۹) Balancing selection and MHC. Genetica ۱۰۴: ...
  • Hedrick, P. W. (۲۰۰۲) Pathogen resistance and genetic variation at ...
  • Khosravi, F., Amirzargar, A., Sarafnejad, A., Nicknam, M. H., Alimoghadam, ...
  • Koo, J. W., Oh, S. H., Chang, S. O., Park, ...
  • Lancaster, A., Nelson, M. P., Single, R. M., Meyer, D. ...
  • Luikart, G. and Cornuet, J. M. (۱۹۹۸) Empirical evaluation of ...
  • Manly, B. F. J. (۱۹۸۵) The statistics of natural selection. ...
  • Marsh, S. G. E., Albert, E. D., Bodmer, W. F., ...
  • Migita, K., Nakamura, T., Maeda, Y., Miyashita, T., Origuchi, T., ...
  • Miller, S. A., Dykes, D. D. and Polesky, H. F. ...
  • Nielsen, R. (۲۰۰۱) Statistical tests of selective neutrality in the ...
  • Parham, P. and Ohta, T. (۱۹۹۶) Population Biology of Antigen ...
  • Piertney, S. B. and Oliver, M. K. (۲۰۰۶) The evolutionary ...
  • Ramezani, A., Hasanjani Roshan, M. R., Kalantar, E., Eslamifar, A., ...
  • Robinson, J., Malik, A., Parham, P., Bodmer, J. G. and ...
  • Sarafnejad, A., Khosravi, F., Alimoghadam, K., Dianat, S., Ansaripour, B., ...
  • Schwaiger, F. W., Buitkamp, J., Weyers, E. and Epplen, J. ...
  • Schwaiger, F. W., Weyers, E., Buitkamp, J., Ede, A. J., ...
  • Shams, S., Amirzargar, A. A., Yousefi, M., Rezaei, N., Solgi, ...
  • Sommer, S. (۲۰۰۵) The importance of immune gene variability (MHC) ...
  • Vallian, S. and Lahmi, R. (۲۰۰۹) Genetic variation of informative ...
  • Vallian, S. and Moeini, H. (۲۰۰۶) Genotyping of five polymorphic ...
  • Vallian, S., Tajadod, M. and Hojati, Z. (۲۰۱۰) Characterization of ...
  • Watterson, G. A. (۱۹۷۷) Heterosis or neutrality? Genetics ۸۵: ۷۸۹-۸۱۴ ...
  • Wu, J. S., James, I., Wei, Q., Castley, A., Christiansen, ...
  • نمایش کامل مراجع