Molecular Docking and Molecular Dynamics Studies of Ectoine Drug and Polyamidoamine/Ectoine Conjugates With the ۶twk Protein
محل انتشار: دوفصلنامه ایرانی شیمی تجزیه، دوره: 8، شماره: 1
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 169
فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJAC-8-1_006
تاریخ نمایه سازی: 23 خرداد 1400
چکیده مقاله:
The interactions of ۶twk protein with Ectoine drug, Polyamidoamine (PAMAM) /Ectoine and histidine modified PAMAM/Ectoine were investigated using molecular docking and molecular dynamics simulation. Based on the results of molecular docking increasing of binding energy and the decreasing of inhibition constant of the compounds, increase their inhibitory activity. Protein stability in complex with these ligands was investigated using molecular dynamics simulation approach. Results molecular dynamics simulation displayed that histidine modified PAMAM/Ectoine with the lowest mean square displacement (MSD) is the better suitable to deliver the ectoine drug. This causes the most controlled/diffusion of ectoine drug molecule. So, histidine modified PAMAM/Ectoine conjugate can be introduced for further investigations on interaction of ectoine drug and ۶twk protein.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
Nosrat Madadi Mahani
Department of Chemistry, Payame Noor University, ۱۹۳۹۵-۴۶۹۷ Tehran, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :