شناسایی رونوشت های حلقوی سویا در پاسخ به تنش های کمبود نیتروژن و فسفر
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 143
فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_GEB-9-2_002
تاریخ نمایه سازی: 4 مهر 1400
چکیده مقاله:
سویا که به عنوان یکی از مهم ترین منابع روغن و پروتئین در جهان شناخته می شود، مانند دیگر گونه های گیاهی در معرض تنش های غیرزیستی متنوعی مانند تنش های کمبود فسفر و نیتروژن که از جمله تنش های محدود کننده رشد و میزان تولید محصول هستند قرار دارد. رونوشت های حلقوی که به عنوان رونوشت های جدید غیر رمزکننده شناخته می شوند، نقش مهمی را در پاسخ گیاهان به تنش های زیستی و غیرزیستی بر عهده دارند. با این حال، چگونگی بیان رونوشت های حلقوی در پاسخ به تنش کمبود فسفر و نیتروژن هنوز به طور دقیق مشخص نشده است. در این مطالعه بذرهای سویا تحت تنش های مختلف کمبود فسفر و نیتروژن کشت شد و نمونه برداری از ریشه گیاهان جهت استخراج ترانسکریپتوم انجام شد. پس از استخراج ترانسکریپتوم از نمونه ها و اطمینان از کمیت و کیفیت آن ها، آزمایش توالی یابی با استفاده از نسل جدید توالی یابی انجام شد. پس از دریافت نتایج حاصل از توالی یابی، کیفیت داده ها مورد ارزیابی قرار گرفت و رونوشت های حلقوی با استفاده از پنچ روش مختلف شناسایی شدند. در نهایت نحوه و الگوی بیان رونوشت های حلقوی و نیز عملکرد ژن های رمز کننده آن ها مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل از توالی یابی بیش از ۳۶۰ میلیون خوانش تولید کرد و در مجموع ۲۰۳۳ رونوشت حلقوی در همه تیمارها شناسایی شد. با وجود اینکه برخی از رونوشت های حلقوی به طور همزمان در دو یا چند تیمار بیان شدند، اکثر آن ها الگوی بیان وابسته به نوع تیمار تنش داشتند. نتایج نشان داد که رونوشت های حلقوی احتمالا از طریق اتصال به مولکول های هدف، نقش خود را ایفا می کنند. نتایج به دست آمده در این مطالعه نقش احتمالی رونوشت های حلقوی در پاسخ به تنش کمبود نیتروژن و فسفر را پیشنهاد می کند.
کلیدواژه ها:
Circular RNA ، Nitrogen ، Phosphorus ، Soybean ، Stress ، سویا ، تنش ، فسفر ، نیتروژن ، رونوشت حلقوی
نویسندگان
سعید بابائی
Institute of Biotechnology, Shiraz University, Shiraz, Iran
اسماعیل ابراهیمی
Institute of Biotechnology, Shiraz University, Shiraz, Iran
علی نیازی
Institute of Biotechnology, Shiraz University, Shiraz, Iran
مهناز نظامیوند چگینی
Institute of Biotechnology, Shiraz University, Shiraz, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :