بررسی پروتئوم رقم متحمل به خشکی سویا با استفاده از روش دی متیل لیبلینگ
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 208
فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_GEB-9-2_008
تاریخ نمایه سازی: 4 مهر 1400
چکیده مقاله:
سویا یکی از مهمترین محصولات تجاری کشاورزی در سر تا سر دنیا است که تولید آن به دلیل آسیب های ناشی از تنش های محیطی محدود شده است. از جمله مهمترین تنش ها می توان به خشکی یا کمبود آب خاک اشاره کرد. در این تحقیق از یک نوع روش نشاندار کردن به نام Isotope dimethyl labeling برای پروتئومیکس کمی و یا بررسی تغییرات پروتئینی مرتبط با پاسخ به تنش خشکی در دو رقم حساس و متحمل به خشکی سویا ، استفاده شد. با استفاده از تجزیه و تحلیل داده های حاصل از کروماتوگرافی مایع طیف سنجی جرمی LC-MS/MS، ۱۷۷۸۷ پپتید شناسایی شدند که از این تعداد، ۸۷۴ پپتید (مربوط به ۲۶۰ گروه پروتئینی) بعنوان تکرارپذیر و منحصر به فرد (Non-redundant/ unique repeatable peptides) در رقم متحمل، که دارای تغییرات معنادار بیان در مقایسه با رقم حساس بودند تعیین گردیدند. همچنین یافته ها نشان داد که از میان این ۲۶۰ گروه پروتئینی در رقم متحمل ، ۱۴۲ (۵۵%) گروه افزایش بیان و ۱۱۸ (۴۵%) گروه کاهش بیان نشان دادند. فعالیت و دومین های این پروتئین های دارای سطوح بیان معنی دار، با استفاده از تجزیه و تحلیل های Gene Ontology و InterPro protein domain انجام و نشان داده شد که اکثر این پروتئین ها، در گروه های پروتئینی مرتبط با سوخت و ساز انرژی، فعالیت های فتوسنتزی، مهار گونه های فعال اکسیژن، فعالیت کانالی و انتقال مواد، تنظیم کنند ه ی بیان ژن و ترجمه، سوخت و ساز مشتقات قندی و مواد ارگانیک و کاتابولیک قندهای الکلی قرار دارند.
کلیدواژه ها:
Drought-tolerant cultivar ، Gene Ontology ، Isotopic dimethyl labeling ، InterPro protein domain ، proteomics ، پروتئومیکس ، رقم متحمل به خشکی سویا ، دومین ، نشاندار کردن ، Gene Ontology
نویسندگان
عطیه مرادی
, Institute of Biotechnology, School of Agriculture, Shiraz University, Shiraz, Iran
علیرضا افشاریفر
Plant Virology Research Center, School of Agriculture, Shiraz University, Shiraz, Iran
علی نیازی
Institute of Biotechnology, School of Agriculture, Shiraz University, Shiraz, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :