ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

بررسی شاخص های تنوع ژنتیکی در یک جمعیت از گاو هلشتاین با استفاده از نشانگرهای متراکم اسنیپ

محل انتشار: فصلنامه پژوهشهای تولیدات دامی، دوره: 12، شماره: 32
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 436

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1274434

شناسه ملی سند علمی:

JR_RAP-12-32_016

تاریخ نمایه سازی: 4 مهر 1400

چکیده مقاله:

کاهش میزان تنوع ژنتیکی و به­ تبع آن افزایش تجمعی میزان هم­خونی از جمله عوامل تهدید کننده صنعت پرورش گاو شیری محسوب می­ شوند. هدف از پژوهش حاضر، ارزیابی شاخص­ های تنوع ژنتیکی (توزیع عدم تعادل لینکاژی، آماره هتروزیگوتی مشاهده ­شده و مورد انتظار، آماره Fis، توزیع فراوانی آلل های نادر، میزان اتوزیگوتی و تجزیه به مولفه­ های اصلی) در گاو هلشتاین با استفاده از نشانگرهای متراکم اسنیپ بود. داده­ های ژنوتیپی متعلق به ۲۵ گاو ماده هلشتاین حاصل از تراشه اسنیپ گاوی ۵۰ هزارتایی، اهدایی از شرکت تجاری آلتادلتا ژنتیک تجزیه و تحلیل شد. محاسبات آماری شاخص­ های مولکولی مذکور از طریق نرم­ افزار معروف پلینک، نسخه ۱/۹تحت محیط R صورت گرفت. میانگین فراوانی آلل نادر (۰/۲۸)، میانگین فراوانی هتروزیگوتی مشاهده ­شده و هتروزیگوتی مورد انتظار به ­ترتیب (۰/۳۸، ۰/۳۷)، آماره شاخص تثبیت (Fis) (منفی۰/۰۳۲)، آماره Fhom(۰/۰۳۲۸-) اندازه ­گیری شد. همچنین، نتایج تجزیه به مولفه­ های اصلی، تنوع و پراکنش معنی­ دار بالایی را نشان داد که تاییدی بر مطابقت و هم­خوانی همه آماره­ های مولکولی اندازه­ گیری شده و بالا بودن میزان تنوع ژنتیکی اندازه­ گیری شده بود. از آنجایی که، شاخص ROH، از اطلاعات توالی نوکلئوتیدی یکسان انتقال یافته به دو فرد حاصل می ­شود لذا، در مقایسه با شاخص Fis، معیار آماری مناسب­تری برای مطالعه میزان هم­خونی، می­ باشد. نتیجه­ گیری نهایی این که، بکارگیری نشانگرهای متراکم اسنپ می تواند، ابزاری مناسب برای ارزیابی وضعیت تنوع ژنتیکی و هم­خونی جمعیت­ های دامی محسوب شود.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

رئوف شاکری

Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran

آرش جوانمرد

Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran

کریم حسن پور

Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran

مختار علی عباسی

Animal Science Research Institute of Iran, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO) Iran

سید مصطفی مظلوم

Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Ferdowsi, Mashhad

مجید خان سفید

Agri Bioscience, Agriculture Victoria Services, Bundoora, VIC, Australia

مهران رحیمی ورپشتی

M.Sc Animal Genetics and Breeding, CEO Arian Delta Gene Company, Tehran, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Anonymous. ۲۰۱۷. Inbreeding Update- August ۲۰۱۷. Canadian Dairy Network ...
  • Barani, S., S.M. Moradi, J.A. Nejati, M.H. Moradi, M. Gholizadeh ...
  • Biegelmeyer, P., C.C. Gulias-Gomes, A.R. Caetano, J.P. Steibel and F. ...
  • Dadar, M., S.A. Mahyari, M. Rokouei and M.A. Edriss. ۲۰۱۴. ...
  • Dash S, A. Singh, A.K. Bhatia, S. Jayakumar, A. Sharma, ...
  • Edea, Z., H. Dadi, T. Dessie, S.H. Lee and K.S. ...
  • Falconer, D.S. and T.F.C. Mackay. ۱۹۹۶. An introduction to quantitative ...
  • Food and Agriculture Organization (FAO). ۲۰۱۳. In vivo conservation of ...
  • Food and Agriculture Organization (FAO). ۲۰۱۵. The second report on ...
  • Forogh Ameri, N. ۲۰۱۷. Exploring the genomes of Iranian native ...
  • Forutan, M., S. Ansari Mahyari and C. Baes. ۲۰۱۸. Inbreeding ...
  • Gandini, G. and K. Oldenbroek. ۲۰۰۷. Strategies for moving from ...
  • García-Gámez, E., G. Sahana, B. Gutiérrez-Gil and J.J. Arranz. ۲۰۱۲. ...
  • Goddard, M.E. ۲۰۰۹. Genomic selection: Prediction of accuracy and maximization ...
  • Goddard, M.E. ۱۹۹۲. Optimal effective population size for the global ...
  • Gomez-Raya, L., C. Rodríguez, C. Barragán and L. Silió. ۲۰۱۵. ...
  • Bowman, P.J., A.C. Chamberlain, K. Verbyla and M.E. Goddard. ۲۰۰۹. ...
  • Khatkar, M.S., K.R. Zenger, M. Hobbs, R.J. Hawken, J.A. Cavanagh, ...
  • Martikainen, K., M. Koivula and P. Uimari. ۲۰۲۰. Identification of ...
  • Meuwissen, T.H.E. ۲۰۰۹. Towards consensus on how to measure neutral ...
  • Meuwissen, T.H.E. ۱۹۹۷. Maximizing the response of selection with a ...
  • Meuwissen, T.H.E. ۲۰۰۹. Towards consensus on how to measure neutral ...
  • Mustafa, H., H. Heather, J. EuiSoo, K. Ahmad, N. Ali, ...
  • Naghavian, S., S. Davoudali and A. Mobaraki. ۲۰۱۸. Estimation of ...
  • Oldenbroek, J.K. ۲۰۰۷. Utilisation and conservation of farm animal genetic ...
  • Oldenbroek, K. ۲۰۰۷. Utilisation and conservation of farm animal genetic ...
  • Qanbari, S. ۲۰۰۹. Study of genomic structure and signatures of ...
  • Qwabe, S.O., E. VanMarle-Koster, A. Maiwashe and F.C. Muchadeyi. ۲۰۱۳. ...
  • Rahmaninia, J., S.R. Miraei-Ashtiani and H. Moradi Shahrbabak. ۲۰۱۵. Unsupervised ...
  • Sargolzaei, M., F.S. Schenkel, G.B. Jansen and L.R. Schaeffer. ۲۰۰۸. ...
  • Simianer, H. ۲۰۰۵. Decision making in livestock conservation. Ecological Economics, ...
  • Urgul, A., T. Szmatoła, P. Topolski, I. Jasielczuk, K. Żukowski ...
  • Yang, W., X. Kang, Q. Yang, Y. Lin and M. ...
    • نمایش کامل مراجع