واریانت های جدید ویروئید شماره سه مرکبات استان فارس

ویروئید شماره سه مرکبات (Citrus viroid-III= CVd-III) دامنه میزبانی محدودی داشته و علائم اختصاصی در بالنگ اتراگ ایجاد می­کند که شامل ایجاد چین و چروک در دمبرگ، قهوه ای شدن و خمیدگی برگ، پژمردگی و کجی برگ به خاطر نکروز نقطه ای رگبرگ میانی می باشد. ویروئید شماره سه مرکبات باعث کاهش معنی دار قطر تنه درختان پیوندی والنسیا و پایه نارنج سه برگچه ای و حجم سایه انداز درختان آلوده می گردد. در این مطالعه، تعدادی نمونه بدون علائم مشخص از باغ های مرکبات استان فارس از نظر وجود ویروئید، مورد بررسی قرار گرفتند. پس از استخراج آر. ان. ای. از گیاه، به وسیله واکنش زنجیره ای پلیمراز با نسخه برداری معکوس، همسانه سازی و تعیین توالی ژنوم کامل، ویروئیدهای موجود در نمونه های آلوده بررسی گردیدند. در ادامه از نظر مولکولی (ترکیب نوکلئوتیدی، ساختمان اولیه و ثانویه، وزن مولکولی، روابط فیلوژنتیکی و درصد تشابه نوکلئوتیدی)، مقایسه ای بین واریانت های موجود انجام گرفت. در این مطالعه سه واریانت جدید CVd-III (واریانت های شماره ۱، ۲ و ۳) از باغ های مرکبات استان فارس ردیابی گردید. از نظر ترادف نوکلئوتیدی، تشابه CVd-III-۲ و  CVd-III-۳ بسیار زیاد (۹۹%) است ولی این دو واریانت فقط ۹۳% با CVd-III-۱ شباهت دارند. گروه بندی فیلوژنتیکی نیز نشان داد که CVd-III-۲ و  CVd-III-۳ به همراه CVd-III-۱۱ (گزارش شده از فلسطین اشغالی) و  CVd-III-۱۲(گزارش شده از ایالات متحده آمریکا) در یک گروه و CVd-III-۱ به همراه CVd-III-a در گروه دیگری قرار می­گیرند که امر تفاوت در منشا تکامل واریانت های موجود در استان فارس را نشان می دهد.