تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه D-Loopاز DNA میتوکندری پلنگ ایرانی

سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 205

فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-3-2_007

تاریخ نمایه سازی: 12 مهر 1400

چکیده مقاله:

پلنگ ایرانی(Panthera pardus saxicolor)  بزررگترین زیر گونه پلنگ در دنیا محسوب می شود. اما با توجه به کاهش شدید جمعیت و انقراض آن در برخی مناطق، توجه بیشتر به این زیر گونه خصوصا از دیدگاه ژنتیک حفاظتی دارای اهمیت زیادی می باشد. هدف از این مطالعه، بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی ناحیه D-Loop ازDNA میتوکندری پلنگ ایرانی بود. برای انجام این تحقیق تعداد ۶ نمونه بیولوژیک که شامل استخوان و پوست بود از پارک ملی تندوره استان خراسان رضوی طی سالهای ۱۳۸۷ تا ۱۳۹۰ جمع آوری شد. پس از استخراج DNA تکثیر قطعه ۸۰۰ جفت بازی از ناحیه D-Loop میتوکندری با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز و پرایمرهای عمومی L۱۵۹۲۶ وH۱۶۴۹۸ براساس روش استاندارد انجام گردید. توالی یابی ناحیه تکثیر شده با استفاده از دستگاه خودکار ABI ۳۱۳۰ به روش اتوماتیک سانگر صورت گرفت و به منظور تعیین فاصله ژنتیکی با توالی های حاصل از مطالعات دیگر، مورد مقایسه قرار گرفتند. نتایج نشان داد که در بین توالی های نوکلئوتیدی نمونه های مورد مطالعه، تفاوت هاپلوتایپی وجود نداشت. همچنین نتایج آزمون فیلوژنتیکی با استفاده از روش Neighbor-Joining نشان داد که پلنگ ایرانی در گروه P. pardus قرار می گیرد و از لحاظ هاپلوتایپی مشابه زیر گونه saxicolor  می باشد.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bellagamba F, Moretti VM, Comincini S, Valfare F (۲۰۰۱). Identification ...
  • Blanford WT (۱۸۷۳). Note on the gazelles of lndia and ...
  • Bruford M, Bradley D, Luikart G (۲۰۰۳). DNA markers reveal ...
  • Charruau P, Fernandes C, Wengel PO-T, Peters J, Hunter L, ...
  • Ewing B, Green P (۱۹۹۸). Base-Calling of Automated Sequencer Traces ...
  • Eyre-walker A, Awadalla P (۲۰۰۱). Does human mtDNA recombine? Journal ...
  • Firouz E (۲۰۰۵) The Complete Fauna of Iran. I.B.Tauris, London ...
  • Funk DJ, Omland KE (۲۰۰۳). Species-level Paraphyly and Polyphyly: Frequency, ...
  • Khorozyan I, Malkhasyan A, Asmaryan S (۲۰۰۵). The Persian leopard ...
  • Khorozyan IG, Gennady F, Baryshnikov GF, Abramov AV (۲۰۰۶). Taxonomic ...
  • Kiabi BH, Dareshouri BF, Ghaemi RA, Jahanshahi M (۲۰۰۲). Population ...
  • Kocher TD, Thomas WK, Meyer A, Edwards SV, Paabo S, ...
  • Luo S-J, Kim J-Hu, Johnso WE, Walt Jevd, Yuhki N, ...
  • Meyer A, Kocher TD, Basasibwaki P, Wilson AC (۱۹۹۰). Monophyletic ...
  • Miththapala S (۱۹۹۲). Genetic and morphological variation in the leopard ...
  • Miththapala S, Seidensticker J, O'brien SJ (۱۹۹۶). Phylogeographic Subspecies Recognition ...
  • Nowell K, Jackson P (۱۹۹۶). Leopard Panthera pardus (Linnaeus, ۱۷۵۸) ...
  • O’Rourke DH, Hayes G, Carlyle SW (۲۰۰۰). Ancient DNA Studies ...
  • Pocock RI (۱۹۲۷). Description of two subspecies of leopards. Annals ...
  • Sanei A (۲۰۰۷). Analysis of Leopard (Panthera pardus) Status in ...
  • Sanei A, Zakaria M (۲۰۱۱a). Distribution pattern of the Persian ...
  • Sanei A, Zakaria M (۲۰۱۱b). Survival of the Persian leopard ...
  • Shoemaker AH (۱۹۸۵). ۱۹۸۳ Studbook for rare leopards, Panthera pardus ...
  • Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, ...
  • Uphyrkina O, Johnson WE, Quigley HB, Miquelle DG, Marker L, ...
  • Vural HC, Tirpan AA (۲۰۱۰). Comparison and Development of A ...
  • Yu L, Zhang Y-p (۲۰۰۵). Phylogenetic studies of pantherine cats ...
  • Zukowsky L (۱۹۵۹). Persische Panther. Der Zoologische Garten ۲۴:۳۲۹-۳۴۴ ...
  • نمایش کامل مراجع