شناسایی نشانگرهای رتروترنسپوزونی مرتبط با صفات آگرومورفولوژیک در جمعیت های مختلف آفتابگردان آجیلی (Helianthus annuus L.)تحت شرایط نرمال و تنش خشکی

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 254

فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCB-8-20_021

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

چکیده مقاله:

در این مطالعه به منظور شناسایی نشانگرهای ملکولی مرتبط با ۲۲ صفت آگرومورفولوژیک در ۴۸ توده مختلف آفتابگردان آجیلی بر اساس مدل های GLM و MLM، از ۱۲ آغازگر مبتنی بر رتروترنسپوزن (۷ آغازگر IRAP و ۵ آغازگر REMAP) استفاده شد. تجزیه کلاستر با روش Neighbor Joining، توده های آفتابگردان مورد مطالعه را به ۳ گروه اصلی تقسیم بندی کرد. مطالعه ساختار جمعیت به عنوان پیشنیازی برای انجام تجزیه ارتباط به روش بیزین، نشان داد که ۲ زیر گروه احتمالی (۲K=) در جمعیت مورد مطالعه وجود دارد. در تجزیه ارتباط به روش GLM و MLM، به ترتیب ۱۳۱ و ۱۱۷ مکان مرتبط (۰۱/۰>P) با صفات مورد مطالعه در محیط های مختلف تحت بررسی شناسایی شدند. وجود نشانگرهای مشترک در میان برخی صفات بررسی شده در مطالعه حاضر ممکن است ناشی از اثرات پلیوتروپی و یا پیوستگی نواحی ژنومی دخیل در کنترل صفات باشد. نتایج بدست آمده از این مطالعه اطلاعات ارزشمندی در زمینه مبنای ژنتیکی صفات مورد مطالعه ارائه داد که از این اطلاعات می توان در برنامه های اصلاحی و تولید ارقام با میزان عملکرد بالا در آفتابگردان استفاده نمود.

نویسندگان

مرجان جنت دوست

Institute of Biotechnology, Urmia University

حیدر عزیزی

University of Guilan

محمد علی ابراهیمی

Payame Noor University, Tehran,

اسماعیل قلی نژاد

Payame Noor University

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abdi, N., R. Darvishzadeh, M. Jafari, A. Pirzad and P. ...
  • Abdollahi Mandoulakani, B., Y. Piri, R. Darvishzadeh, I. Bernoosi and ...
  • Allinne, C., P. Maury, A. Sarrafi and P. Grieu. ۲۰۰۹. ...
  • Al-Maskri, A.H., M. Sajjad and S.H. Khan. ۲۰۱۲. Association mapping: ...
  • Breseghello, F. and M.E. Sorrells. ۲۰۰۶. Association mapping of kernel ...
  • Davar R., R. Darvishzadeh, A. Majd, Y. Ghosta and A. ...
  • Doyle, J.J. and J.L. Doyle. ۱۹۹۰. Isolation of plant DNA ...
  • Evanno, G., S. Regnaut and J. Goudet. ۲۰۰۵. Detecting the ...
  • Flint-Garcia, S.A., A.C. Thuillet, J. Yu, G. Pressoir, S.M. Romero, ...
  • Fusari CM., J.A.D. Rienzo, C. Troglia, V. Nishinakamasu, M.V. Moreno, ...
  • Gholinezhad, E. ۲۰۱۴. Effect of water deficit stress, different rates ...
  • Gordon, D. and S.J. Finch. ۲۰۰۵. Factors affecting statistical power ...
  • Jun, T.H., K. Van, M.Y. Kim, S.H. Lee and D.R. ...
  • Karlsson, E.K., I. Baranowska, C.M. Wade, N.H.C.S. Hillbertz and M.C. ...
  • Kiani, P.S., P. Grieu, P. Hewezi, L. Gentzbittel and A. ...
  • Lu, G. and E. Hoeft. ۲۰۰۷. Sunflower. A compendium of ...
  • Mackay, T.F.C., E.A. Stone and J.F. Ayroles. ۲۰۰۹. The genetics ...
  • Mandel, J.R., J.M. Dechaine, L.F. Marlek and J.M. Burke. ۲۰۱۱. ...
  • Nordborg, M. and S. Tavare. ۲۰۰۲. Linkage disequilibrium: What history ...
  • Oraguzie, N.C., P.L. Wilcox, E.H.A. Rikkerink and H.N. De Silva. ...
  • Pasam, R.K., R. Sharma, M. Malosetti, F. Eeuwijk, G. Haseneyer, ...
  • Perrier, X. and J.P. Jacquemoud-Collet. ۲۰۰۶. DARwin software. http://darwin.cirad.fr/darwin ...
  • Pritchard, J.K., M. Stephens and P. Donnelly. ۲۰۰۰. Inference of ...
  • Rafalski, A. and M. Morgante. ۲۰۰۴. Corn and humans: recombination ...
  • Rashidimonfarad, S., M. Mardi, A. Hosseinzade and M.R. Naghavi. ۲۰۰۶. ...
  • Remington, D.L., J.M. Thornsberry, Y. Matsuoka, L.M. Wilson, S.R. Whitt, ...
  • Saeed, M., G. Wangzhen and Z. Tianzhen. ۲۰۱۴. Association mapping ...
  • Skoric, D. ۲۰۰۹. Sunflower breeding for resistance to abiotic stresses. ...
  • Skøt, L., J. Humphreys, M.O. Humphreys, D. Thorogood, J. Gallagher, ...
  • Spataro, G., B. Tiranti, P. Arcaleni, I.E. Bellucc, G. Attene, ...
  • Tommasini, L., T. Schnurbusch, D. Fossati, F. Mascher and B. ...
  • Vanitha, J., N. Manivannan and R. Chandirakala. ۲۰۱۴. Qualitative trait ...
  • Vollmann, J. and I. Rajcan. ۲۰۰۹. Handbook of Plant Breeding. ...
  • Vukich, M., T. Giordani, G. Natali and A. Cavallini. ۲۰۰۹. ...
  • Yu, J. and E.S. Buckler. ۲۰۰۶. Genetic association mapping and ...
  • Zali, H., T. Hasanloo, O. Sofalian, A. Asghari and M. ...
  • Ziaeifard R., R. Darvishzadeh and I. Bernousi ۲۰۱۶. Study of ...
  • نمایش کامل مراجع