طراحی پرایمرهای اختصاصی برای مطالعه تنوع تک نوکلئوتیدی (SNP) در ژن ها و تعیین عملکرد آنها
محل انتشار: پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، دوره: 7، شماره: 16
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 205
فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCB-7-16_016
تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400
چکیده مقاله:
اطلاعات زیادی در مورد توالی بسیاری از ژنها بدون آنکه عملکرد این توالیها شناخته شده باشد، وجود دارد. از این رو تحقیقات فراوانی از طریق روشهای ژنتیکی معکوس برای پر کردن شکاف بین ساختار و عملکرد این توالیها انجام گرفته است. بدین منظور آزمایشی با هدف چگونگی طراحی پرایمرهای اختصاصی ژن، که بتوانند تنوع تک نوکلئوتیدی و تاثیر آن بر عملکرد ژن را تعیین نمایند، در مرکز بین المللی تحقیقات کشاورزی در مناطق خشک (ICARDA) انجام گرفته است. ژنهای مورد بررسی در این آزمایش دو ژن متحمل به تنش شوری در جو، CBL۴ و HvHKT۱، بوده است و هشت جفت پرایمر برای این دو ژن طراحی گردید. کارآیی پرایمرها برای تکثیر منطقه مورد نظر و نشان دادن تنوع تک نوکلئوتیدی از طریق واکنش زنجیرهای پلیمراز۱ و توالی یابی قطعات تکثیری مورد ارزیابی قرار گرفت. همه پرایمرهای طراحی شده دارای قابلیت بالایی از نظر تکثیر قطعات ژنومی مربوط و تعیین تنوع تک نوکلئوتیدی بودند. این پرایمرها اختصاصی بوده و از مناطق کدکننده ژن طراحی شدند. لذا به کمک آنها میتوان نقش تنوع نوکلئوتیدی موجود بین ژنوتیپهای مختلف در تغییر عملکرد ژن را مورد مطالعه قرار داد. همچنین انتخاب به کمک این مارکرهای اختصاصی دارای کارآیی بیشتری نسبت به انتخاب بر اساس مارکرهای پیوسته با ژن میباشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
راحله خادمیان
دانشگاه بین المللی امام خمینی قزوین
نادعلی بابائیان جلودار
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سید محتبی خیام نکوئی
پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج
محسن مردی
پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج
بابک ناخدا
پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :