مطالعه ژن های کاندیدا موثر بر صفات دنبه در محدوده مشخصی از کروموزوم شماره ۵ در گوسفندان لری بختیاری و زل با روش PCR-SSCP

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 217

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_RAP-8-17_013

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

چکیده مقاله:

کیفیت گوشت و ترکیب لاشه از مهم­ترین صفات اقتصادی در گوسفند به شمار می روند. چربی بدن و دنبه از جمله عوامل تاثیرگذار بر کیفیت لاشه و گوشت تولیدی در هر نژاد بوده و وقوع جهش در توالی ژن­های کنترل­کننده این صفات می­تواند عملکرد حیوان و بالطبع ارزش ارثی را تحت تاثیر قرار دهد. هدف از این مطالعه بررسی چند شکلی برخی نواحی از ژن های SAR۱B، SEC۲۴A و VDAC۱ در منطقه ژنومی کاندیدا برای صفات چربی و دنبه روی کروموزوم  شماره ۵ گوسفند بود. نمونه­های خون به طور تصادفی از تعداد ۳۰۰ راس گوسفند لری بختیاری و ۱۰۰ راس گوسفند زل جمع­آوری شد و استخراج DNA به روش نمکی بهینه یافته انجام شد. واکنش­های زنجیره­ای پلیمراز (PCR) برای تکثیر قطعه های ۴۷۸، ۵۷۹ و ۳۴۸ جفت بازی ژن های مورد مطالعه با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی،  و تعیین ژنوتیپ نمونه­ها با تکنیک SSCP  انجام شد. نتایج به دست آمده سه الگوی باندی A، B و C را برای ژن SAR۱B در گوسفند لری بختیاری نشان داد، اما این جایگاه ژنی در گوسفند زل تک شکل بود. برای ژن SEC۲۴A در هر دو نژاد سه الگوی باندی A، B  و C، اما جایگاه VDAC۱ در دو نژاد تک شکل بود. تاثیر الگوهای باندی ژن SAR۱B بر ویژگی­های دنبه معنی­دار (۰۰۱/۰P <) بود، به طوری که الگوی باندی A بیشترین مقادیر مشاهده شده برای محیط بالا، محیط پایین، ارتفاع و وزن دنبه را نشان داد. الگوهای مختلف باندی ژن SEC۲۴A به طور معنی­داری با ویژگی­های دنبه در ارتباط بود (۰۰۱/۰P <) و الگوی باندی B بیشترین مقادیر را نشان داد. با توجه به تک شکل بودن جایگاه ژنی SAR۱B در نژاد بدون دنبه زل و چند شکل بودن آن در نژاد دنبه دار لری بختیاری و همچنین چند شکل بودن جایگاه ژنی SEC۲۴A در هر دو نژاد مورد مطالعه، این جایگاه­های نشانگری را  می توان به عنوان ژن های کاندیدای احتمالی موثر بر ویژگی های دنبه در نژادهای گوسفند دنبه دار مطرح کرد. مطالعه بیشتر نواحی دیگر (اگزون، اینترون و نواحی تنظیمی) این دو ژن  و ارتباط آنها با صفات دنبه برای تایید نتایج پیشنهاد می­شود.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Archibald, A.L., N.E. Cockett, B.P. Dalrymple, T. Faraut, J.W. Kijas, ...
  • Asadi, A., H. Moradi Shahrbabak, P. Azizi, S. Elahian and ...
  • Barzehkar, R., A. Salehi and F. Mahjoubi. ۲۰۰۹. Polymorphisms of ...
  • Bianchi, P., E. Fermo, C. Vercellati, C. Boschetti, W. Barcellini ...
  • Chen, X.W., H. Wang, K. Bajaj, P. Zhang, Z.M. Meng, ...
  • Freking, B.A., J.W. Keele, S.D. Shackelford, T.L. Wheeler, M. Koohmaraie, ...
  • GAN, S.Q., Z. Wei, S. Min, L. Huan, Y. Jing-Quan, ...
  • Xin-Hua. ۲۰۱۳. Correlation analysis between polymorphism of the ۹۳۸۳۶۳۵th locus ...
  • Ge, W., M.E. Davis, H.C. Hines, K.M. Irvin and R.C.M. ...
  • Gokdal, O., H. Ulker, F. Karakus, F. Cengiz, C. Temur ...
  • Karamichou, E., R. Richardson, G. Nute, K. Gibson and S. ...
  • Meuwissen, T.H.E. and M.E. Goddard. ۱۹۹۶. The use of marker ...
  • Moradi, M.H., A. Nejati-Javaremi, M. Moradi-Shahrbabak and J.C. McEwan. ۲۰۱۱. ...
  • Moradi, M.H., A. Nejati-Javaremi, M. Moradi-Shahrbabak, K.G. Dodds and J.C. ...
  • Negussie, E., O. Rottmann, F. Pirchner and J. Rege. ۲۰۰۳. ...
  • POPGENE. ۱۹۹۹. Version ۱.۳۲: the user friendly software for population ...
  • Oligo۷. ۲۰۰۹. Version ۷. OLIGO Primer Analysis Software. Molecular Biology ...
  • Sun, Y., G. Zhao, R. Liu, M. Zheng, Y. Hu, ...
  • Vatankhah, M., M. Moradi-Shahrbabak, A. Nejati-Javaremi, S.R. Miraie Ashtiani and ...
  • Wang, Q., H. Li, N. Li, L. Leng, Y. Wang ...
  • Xia, W. and S.F.A. Grant. ۲۰۱۳. The genetics of human ...
  • Zerehdaran, S., S. Alijani and M. Salehinasab. ۲۰۱۶. Detecting Major ...
  • Zhu, X., N. Niu, Y. Liu, T. Du, D. Chen ...
  • Archibald, A.L., N.E. Cockett, B.P. Dalrymple, T. Faraut, J.W. Kijas, ...
  • Asadi, A., H. Moradi Shahrbabak, P. Azizi, S. Elahian and ...
  • Barzehkar, R., A. Salehi and F. Mahjoubi. ۲۰۰۹. Polymorphisms of ...
  • Bianchi, P., E. Fermo, C. Vercellati, C. Boschetti, W. Barcellini ...
  • Chen, X.W., H. Wang, K. Bajaj, P. Zhang, Z.M. Meng, ...
  • Freking, B.A., J.W. Keele, S.D. Shackelford, T.L. Wheeler, M. Koohmaraie, ...
  • GAN, S.Q., Z. Wei, S. Min, L. Huan, Y. Jing-Quan, ...
  • Xin-Hua. ۲۰۱۳. Correlation analysis between polymorphism of the ۹۳۸۳۶۳۵th locus ...
  • Ge, W., M.E. Davis, H.C. Hines, K.M. Irvin and R.C.M. ...
  • Gokdal, O., H. Ulker, F. Karakus, F. Cengiz, C. Temur ...
  • Karamichou, E., R. Richardson, G. Nute, K. Gibson and S. ...
  • Meuwissen, T.H.E. and M.E. Goddard. ۱۹۹۶. The use of marker ...
  • Moradi, M.H., A. Nejati-Javaremi, M. Moradi-Shahrbabak and J.C. McEwan. ۲۰۱۱. ...
  • Moradi, M.H., A. Nejati-Javaremi, M. Moradi-Shahrbabak, K.G. Dodds and J.C. ...
  • Negussie, E., O. Rottmann, F. Pirchner and J. Rege. ۲۰۰۳. ...
  • POPGENE. ۱۹۹۹. Version ۱.۳۲: the user friendly software for population ...
  • Oligo۷. ۲۰۰۹. Version ۷. OLIGO Primer Analysis Software. Molecular Biology ...
  • Sun, Y., G. Zhao, R. Liu, M. Zheng, Y. Hu, ...
  • Vatankhah, M., M. Moradi-Shahrbabak, A. Nejati-Javaremi, S.R. Miraie Ashtiani and ...
  • Wang, Q., H. Li, N. Li, L. Leng, Y. Wang ...
  • Xia, W. and S.F.A. Grant. ۲۰۱۳. The genetics of human ...
  • Zerehdaran, S., S. Alijani and M. Salehinasab. ۲۰۱۶. Detecting Major ...
  • Zhu, X., N. Niu, Y. Liu, T. Du, D. Chen ...
  • نمایش کامل مراجع