ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

مقایسه روش های مختلف آماری در انتخاب ژنومی گاوهای هلشتاین

محل انتشار: فصلنامه پژوهشهای تولیدات دامی، دوره: 7، شماره: 14
سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 157

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1285237

شناسه ملی سند علمی:

JR_RAP-7-14_026

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

چکیده مقاله:

انتخاب ژنومی، ارزش­های ژنتیکی را در صفات پیچیده کمی از طریق ترکیب داده­های ژنومی و فنوتیپی با استفاده از مدل­های آماری پیش­بینی می­کند. صحت پیش­بینی ارزش­های ژنتیکی در جمعیت تحت انتخاب اثر زیادی بر موفقیت این روش انتخاب دارد. مدل آماری که برای برآورد اثرات نشان­گری در جمعیت مرجع از آن استفاده می­شود، از عوامل موثر بر صحت پیش­بینی­ها می­باشد. عوامل مختلفی مانند تراکم نشان­گری، جمعیت مرجع و معماری ژنتیکی صفت بر انتخاب بهترین مدل آنالیز تاثیر­ گذارند. در این مطالعه، گاوهای هلشتاین ایران شبیه­سازی و مدل­های مختلف آنالیز در انتخاب ژنومی این جمعیت بررسی شدند. مدل­ GBLUP و چهار مدل­ بیزی A، B، LASSO و  در حالت­های مختلفی از جمعیت مرجع، تعداد جایگاه­های صفت کمی (QTL) و تراکم نشان گری مقایسه شدند. روش­های بیزی نسبت به روش GBLUP صحت برآورد بالاتری داشتند و این برتری در حالت کم بودن تعداد ژن­های بزرگ اثر و استفاده از اطلاعات جمعیت­های دیگر در تشکیل جمعیت مرجع ایران بیشتر بود. برای انتخاب ژنومی در جمعیت گاوهای هلشتاین ایران، به کارگیری مدل بیز B در جمعیت مرجعی شامل گاوهای نر و ماده و بهره­گیری از اطلاعات جمعیت­های دیگر پیشنهاد می­گردد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Brondum, R.F., G. Su, M.S. Lund, P.J. Bowman, M.E. Goddard ...
  • Clark, S.A., J.M. Hickey and J.H. Van Der Werf. ۲۰۱۱. ...
  • Colombani, C., A. Legarra, S. Fritz, F. Guillaume, P. Croiseau, ...
  • Daetwyler, H.D., B. Villanueva, P. Bijma and J.A.Woolliams. ۲۰۰۷. Inbreeding ...
  • De Los Campos, G., H. Naya, D. Gianola, J. Crossa, ...
  • De Roos, A., B. Hayes and M. Goddard. ۲۰۰۹. Reliability ...
  • Gao, H., G. Su, L. Janss, Y. Zhang and M.S. ...
  • Gianola, D., M. Perez-Enciso and M.A. Toro. ۲۰۰۳. On marker-assisted ...
  • Gianola, D. and J.B. Van Kaam. ۲۰۰۸. Reproducing kernel Hilbert ...
  • Goddard, M. ۲۰۰۹. Genomic selection: prediction of accuracy and maximisation ...
  • Habier, D., R. Fernando and J. Dekkers. ۲۰۰۷. The impact ...
  • Hayes, B., P. Bowman, A. Chamberlain, K. Verbyla and M. ...
  • Hayes, B.J., P.M. Visscher and M.E. Goddard. ۲۰۰۹. Increased accuracy ...
  • Meuwissen, T. ۲۰۰۹. Accuracy of breeding values of ‘unrelated’individuals predicted ...
  • Park, T. and G. Casella. ۲۰۰۸. The bayesian lasso. The ...
  • Sargolzaei, M. and F.S. Schenkel. ۲۰۰۹. QMSim: a large-scale genome ...
  • Shepherd, R.K., T.H. Meuwissen and J.A. Woolliams. ۲۰۱۰. Genomic selection ...
  • Vanraden, P., C. Van Tassell, G. Wiggans, T. Sonstegard, R. ...
  • Verbyla, K.L., B.J. Hayes, P.J. Bowman and M.E. Goddard. ۲۰۰۹. ...
  • Xu, S. ۲۰۰۳. Estimating polygenic effects using markers of the ...
  • Brondum, R.F., G. Su, M.S. Lund, P.J. Bowman, M.E. Goddard ...
  • Clark, S.A., J.M. Hickey and J.H. Van Der Werf. ۲۰۱۱. ...
  • Colombani, C., A. Legarra, S. Fritz, F. Guillaume, P. Croiseau, ...
  • Daetwyler, H.D., B. Villanueva, P. Bijma and J.A.Woolliams. ۲۰۰۷. Inbreeding ...
  • De Los Campos, G., H. Naya, D. Gianola, J. Crossa, ...
  • De Roos, A., B. Hayes and M. Goddard. ۲۰۰۹. Reliability ...
  • Gao, H., G. Su, L. Janss, Y. Zhang and M.S. ...
  • Gianola, D., M. Perez-Enciso and M.A. Toro. ۲۰۰۳. On marker-assisted ...
  • Gianola, D. and J.B. Van Kaam. ۲۰۰۸. Reproducing kernel Hilbert ...
  • Goddard, M. ۲۰۰۹. Genomic selection: prediction of accuracy and maximisation ...
  • Habier, D., R. Fernando and J. Dekkers. ۲۰۰۷. The impact ...
  • Hayes, B., P. Bowman, A. Chamberlain, K. Verbyla and M. ...
  • Hayes, B.J., P.M. Visscher and M.E. Goddard. ۲۰۰۹. Increased accuracy ...
  • Meuwissen, T. ۲۰۰۹. Accuracy of breeding values of 'unrelated'individuals predicted ...
  • Park, T. and G. Casella. ۲۰۰۸. The bayesian lasso. The ...
  • Sargolzaei, M. and F.S. Schenkel. ۲۰۰۹. QMSim: a large-scale genome ...
  • Shepherd, R.K., T.H. Meuwissen and J.A. Woolliams. ۲۰۱۰. Genomic selection ...
  • Vanraden, P., C. Van Tassell, G. Wiggans, T. Sonstegard, R. ...
  • Verbyla, K.L., B.J. Hayes, P.J. Bowman and M.E. Goddard. ۲۰۰۹. ...
  • Xu, S. ۲۰۰۳. Estimating polygenic effects using markers of the ...
    • نمایش کامل مراجع