مکان یابی و بررسی برهمکنش بین جایگاه های ژنومی کنترل کننده صفات مهم زراعی در برنج (Oryza sativa L.)

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 253

فایل این مقاله در 19 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_CRGU-8-4_002

تاریخ نمایه سازی: 3 آبان 1400

چکیده مقاله:

به­ منظور شناسایی QTLهای اصلی و اپیستاتیک و برهمکنش آن­ها با محیط برای برخی صفات مهم زراعی برنج، تعداد ۲۴۲ لاین خالص نوترکیب از دو جمعیت نسل F۶حاصل از تلاقی IR۶۷۰۱۷-۱۸۰-۲-۱-۲ / علی کاظمی (جمعیتIRA) و صالح / علی کاظمی (جمعیتSA) در دو منطقه مورد ارزیابی قرار گرفتند. نقشه پیوستگی دو جمعیت با استفاده از ۸۷ نشانگر ریزماهواره (SSR)، ۱۳۵۶ سانتی­مورگان از ژنوم برنج را با فاصله متوسط ۵۸/۱۵سانتی­مورگان بین نشانگر ها پوشش داد. در مجموع بیست QTL اصلی و ۳۳ QTL اپیستاتیک با آثار مثبت و منفی شناسایی شدند. تعداد پنج QTLاصلی و پنج QTL اپیستاتیک دارای برهمکنش معنی­دار با محیط بودند و هشت QTLاصل یوده QTLاپیستاتیک کنترل کننده صفات زراعی مطلوب شناسایی شدند که هیچ­گونه برهمکنش معنی­داری با محیط نداشتند. اینQTLها شامل: دوQTL اصلی و دو QTL اپیستاتیک برای کاهش ارتفاع بوته، سه QTLاصلی و سه QTL اپیستاتیک برای کاهش تاریخ خوشه­ دهی، یک  QTLاصلی و یک QTL اپیستاتیک برای افزایش طول خوشه و دو QTL اصلی و چهارQTL اپیستاتیک برای افزایش عملکرد دانه بودند که بین ۱۲/۱۱ درصد (qHD۶ ) تا ۵/۲۴ درصد (qGY۱) از تنوع فنوتیپی صفات مربوطه را توجیهکردند. بنابراین، از این QTLهای مطلوب می­توان در برنامه هرمی کردن ژن­ها برای بهبود صفات مورد مطالعه استفاده کرد. همچنین، شش نشانگر پیوسته (RM۴۲۱، RM۱۷۸، RM۳۴۴۱، RM۵۱۰۱، RM۷۵۵۱ و RM۵۳۰۲) با فاصله کم­تر از پنج سانتی­ مورگان با این QTLها شناسایی شدند که می­توان از آن­ها در برنامه­های­ انتخاب به­کمک نشانگر به ­منظور به ­نژادی لاین­های برنج برای صفات مطلوب در نسل­های در حال تفکیک استفاده کرد.

کلیدواژه ها:

اپیستازی ، عملکرد دانه ، لاین های خویش آمیخته نوترکیب ، نقشه پیوستگی

نویسندگان

حسین رحیم سروش

دانشجوی دکتری،گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد،ایران

فرهاد نظریان فیروزآبادی

استاد،گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد،ایران

مریم حسینی چالشتری

استادیار پژوهش، موسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت،ایران

احمد اسماعیلی

دانشیار،گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران

علی اکبر عبادی

استادیار پژوهش، موسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت،ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Amiri Fahliani, R., Khodambashi, M., Hoshmand, S. and Maesomiasl, A. ...
  • Benmoussa, M., Achouch, A. and Zhu, J. ۲۰۰۶. QTL analysis ...
  • Cao, G., Zhu, J., He, C., Gao, Y., Yan, J. ...
  • Chaudhari, P.R., Mishra, D., Koutu, G., Xalxo, S.S., Saxena, R.R., ...
  • Chaudhary, R.C. ۱۹۹۶. Standard evaluation system for rice. International Rice ...
  • Chen, J., Li, X., Cheng, C., Wang, Y., Qin, M., ...
  • Cheng, L., Xu, Q., Zheng, T., Ye, G., Luo, C., ...
  • Deshmukh, R., Singh, A., Jain, N., Anand, S., Gacche, R., ...
  • Fu, Q., Zhang, P., Tan, L., Zhu, Z., Ma, D., ...
  • Guo, L., Xing, Y.Z., Mei, H., Xu, C., Shi, C., ...
  • Hosseini Chaloshtari, M., Houshmand, S., Mohammadi, S., Tarang, A., Khoddambashi, ...
  • Hosseini Chaleshtari, M., Rahimsourosh, H. and Houshmand, S. ۲۰۱۴. Estimation ...
  • Khush, G.S. ۲۰۰۵. What it will take to feed ۵.۰ ...
  • Kwon, S.-J., Cho, Y.-C., Kwon, S.-W., Oh, C.-S., Suh, J.-P., ...
  • Li-Jun, Z., Jiang, L., Xi, L., Hong, C., Liang-Ming, C., ...
  • Li, Z.-K., Yu, S.-B., Lafitte, H., Huang, N., Courtois, B., ...
  • Liao, C., Wu, P., Hu, B. and Yi, K. ۲۰۰۱. ...
  • Lin, H., Liang, Z.-W., Sasaki, T. and Yano, M. ۲۰۰۳. ...
  • Lin, Y.-R., Wu, S.-C., Chen, S.-E., Tseng, T.-H., Chen, C.-S., ...
  • Liu, G., Yang, J., Xu, H. and Zhu, J. ۲۰۰۷. ...
  • Liu, L., Yan, X., Jiang, L., Zhang, W., Wang, M., ...
  • Liu, T., Yu, T. and Xing, Y. ۲۰۱۳. Identification and ...
  • Liu, Y., Chen, L., Fu, D., Lou, Q., Mei, H., ...
  • Lu, X.-L., Niu, A.-L., Cai, H.-Y., Zhao, Y., Liu, J.-W., ...
  • Manly, K.F., Cudmore Jr, R.H. and Meer, J.M. ۲۰۰۱. Map ...
  • McCouch, S.R., Teytelman, L., Xu, Y., Lobos, K.B., Clare, K., ...
  • Mei, H., Li, Z., Shu, Q., Guo, L., Wang, Y., ...
  • Mei, H.W., Luo, L.J., Ying, C.S., Wang, Y.P., Yu, X.Q., ...
  • Murray, M.G. and Thompson, W.F. ۱۹۸۰. Rapid isolation of high ...
  • Nonoue, Y., Fujino, K., Hirayama, Y., Yamanouchi, U., Lin, S. ...
  • Qu, Y., Mu, P., Zhang, H., Chen, C.Y., Gao, Y., ...
  • Rabiei, B. ۲۰۰۷. Linkage map of SSR markers and QTLs ...
  • Rabiei, B., Kordrostami, M., Sabouri, A. and Sabouri, H. ۲۰۱۵. ...
  • Rabiei, B., Masaeli, M. and Tarang, A. L. ۲۰۱۳. Identification ...
  • Rabiei, B. and Sabouri, H. ۲۰۰۸. Mapping genes controlling quantitative ...
  • Rahimi, M., Rabiei, B., Dehghani, H. and Tarang, A.R. ۲۰۱۳. ...
  • Sabouri, H., Sabouri, A. and Dadras, A.R. ۲۰۰۹. Genetic dissection ...
  • Satagopan, J.M., Yandell, B.S., Newton, M.A. and Osborn, T.C. ۱۹۹۶. ...
  • Shen, G., Zhan, W., Chen, H. and Xing, Y. ۲۰۱۴. ...
  • Sheykhpour, A.M., Rabiei, B. and Shirzadian, K.R. ۲۰۱۳. Identification of ...
  • Singh, R., Gautam, P., Saxena, S. and Singh, S. ۲۰۰۰. ...
  • Soroush, H., Eshraghi, A., Salehi, M.M., Ali, A.J., Nahvi, M., ...
  • Temnykh, S., Park, W.D., Ayres, N., Cartinhour, S., Hauck, N., ...
  • Thomson, M., Tai, T., McClung, A., Lai, X., Hinga, M., ...
  • Wang, C., Rutledge, J. and Gianola, D. ۱۹۹۴. Bayesian analysis ...
  • Wang, D., Zhu, J., Li, Z. and Paterson, A. ۱۹۹۹. ...
  • Wang, L., Wang, A., Huang, X., Zhao, Q., Dong, G., ...
  • Wang, P., Zhou, G., Cui, K., Li, Z. and Yu, ...
  • Wang, X., Jin, L., Zhu, H., Wang, S., Zhang, G. ...
  • Wang, X., Pang, Y., Zhang, J., Zhang, Q., Tao, Y., ...
  • Wang, Y., Zang, J., Sun, Y., Ali, J., Xu, J. ...
  • Xie, X., Jin, F., Song, M.-H., Suh, J.-P., Hwang, H.-G., ...
  • Xing, Y., Tan, Y., Hua, J., Sun, X., Xu, C. ...
  • Yan, W.-H., Wang, P., Chen, H.-X., Zhou, H.-J., Li, Q.-P., ...
  • Yang, J., Hu, C., Hu, H., Yu, R., Xia, Z., ...
  • Yang, J. and Zhu, J. ۲۰۰۵. Methods for predicting superior ...
  • Yano, M. and Sasaki, T. ۱۹۹۷. Genetic and molecular dissection ...
  • Ye, Z., Wang, J., Liu, Q., Zhang, M., Zou, K. ...
  • You, A., Lu, X., Jin, H., Ren, X., Liu, K., ...
  • Zhang, J., Ou, X., Hu, H., Du, B., Lv, W., ...
  • Zhang, Q. and Wing, R.A. ۲۰۱۳. Genetics and genomics of ...
  • Zhao, J., Jiang, K., Yang, L., Yang, Q., Wan, X., ...
  • Zhao, X., Qin, Y., Jia, B., Kim, S.-M., Lee, H.-S., ...
  • Zhu, M., Liu, D., Liu, W., Li, D., Liao, Y., ...
  • Zhuang, J.-Y., Fan, Y.-Y., Rao, Z.-M., Wu, J.-L., Xia, Y.-W. ...
  • نمایش کامل مراجع